Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBC6

Lrrn3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn3Q8CBC6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrn3Q8CBC6 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrn3Q8CBC6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrn3Q8CBC6 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrn3Q8CBC6 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrn3Q8CBC6 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrn3Q8CBC6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrn3Q8CBC6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrn3Q8CBC6 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrn3Q8CBC6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrn3Q8CBC6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrn3Q8CBC6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrn3Q8CBC6 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrn3Q8CBC6 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrn3Q8CBC6 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrn3Q8CBC6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrn3Q8CBC6 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrn3Q8CBC6 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrn3Q8CBC6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrn3Q8CBC6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrn3Q8CBC6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrn3Q8CBC6 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrn3Q8CBC6 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrn3Q8CBC6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrn3Q8CBC6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrn3Q8CBC6 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrn3Q8CBC6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrn3Q8CBC6 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrn3Q8CBC6 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrn3Q8CBC6 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrn3Q8CBC6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrn3Q8CBC6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrn3Q8CBC6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrn3Q8CBC6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrn3Q8CBC6 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrn3Q8CBC6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrn3Q8CBC6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrn3Q8CBC6 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrn3Q8CBC6 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrn3Q8CBC6 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrn3Q8CBC6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrn3Q8CBC6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrn3Q8CBC6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrn3Q8CBC6 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrn3Q8CBC6 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrn3Q8CBC6 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrn3Q8CBC6 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrn3Q8CBC6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrn3Q8CBC6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrn3Q8CBC6 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrn3Q8CBC6 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrn3Q8CBC6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrn3Q8CBC6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrn3Q8CBC6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrn3Q8CBC6 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrn3Q8CBC6 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrn3Q8CBC6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrn3Q8CBC6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrn3Q8CBC6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrn3Q8CBC6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrn3Q8CBC6 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrn3Q8CBC6 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrn3Q8CBC6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrn3Q8CBC6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrn3Q8CBC6 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrn3Q8CBC6 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrn3Q8CBC6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrn3Q8CBC6 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrn3Q8CBC6 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrn3Q8CBC6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrn3Q8CBC6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrn3Q8CBC6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lrrn3Q8CBC6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lrrn3Q8CBC6 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lrrn3Q8CBC6 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrn3Q8CBC6 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrn3Q8CBC6 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrn3Q8CBC6 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrn3Q8CBC6 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrn3Q8CBC6 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrn3Q8CBC6 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrn3Q8CBC6 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrn3Q8CBC6 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrn3Q8CBC6 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrn3Q8CBC6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrn3Q8CBC6 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrn3Q8CBC6 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrn3Q8CBC6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrn3Q8CBC6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrn3Q8CBC6 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrn3Q8CBC6 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrn3Q8CBC6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrn3Q8CBC6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrn3Q8CBC6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrn3Q8CBC6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrn3Q8CBC6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrn3Q8CBC6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrn3Q8CBC6 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrn3Q8CBC6 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrn3Q8CBC6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
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