Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBA2

Slfn5, Schlafen family member 5, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn5Q8CBA2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Slfn5Q8CBA2 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Slfn5Q8CBA2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Slfn5Q8CBA2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Slfn5Q8CBA2 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Slfn5Q8CBA2 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Slfn5Q8CBA2 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Slfn5Q8CBA2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Slfn5Q8CBA2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Slfn5Q8CBA2 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Slfn5Q8CBA2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Slfn5Q8CBA2 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Slfn5Q8CBA2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Slfn5Q8CBA2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Slfn5Q8CBA2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Slfn5Q8CBA2 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Slfn5Q8CBA2 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Slfn5Q8CBA2 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Slfn5Q8CBA2 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Slfn5Q8CBA2 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Slfn5Q8CBA2 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Slfn5Q8CBA2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Slfn5Q8CBA2 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Slfn5Q8CBA2 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Slfn5Q8CBA2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Slfn5Q8CBA2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Slfn5Q8CBA2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Slfn5Q8CBA2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Slfn5Q8CBA2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Slfn5Q8CBA2 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Slfn5Q8CBA2 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Slfn5Q8CBA2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Slfn5Q8CBA2 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Slfn5Q8CBA2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Slfn5Q8CBA2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Slfn5Q8CBA2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Slfn5Q8CBA2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Slfn5Q8CBA2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Slfn5Q8CBA2 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Slfn5Q8CBA2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Slfn5Q8CBA2 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Slfn5Q8CBA2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Slfn5Q8CBA2 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Slfn5Q8CBA2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Slfn5Q8CBA2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Slfn5Q8CBA2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Slfn5Q8CBA2 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Slfn5Q8CBA2 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Slfn5Q8CBA2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Slfn5Q8CBA2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Slfn5Q8CBA2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Slfn5Q8CBA2 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Slfn5Q8CBA2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Slfn5Q8CBA2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Slfn5Q8CBA2 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Slfn5Q8CBA2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Slfn5Q8CBA2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Slfn5Q8CBA2 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Slfn5Q8CBA2 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Slfn5Q8CBA2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Slfn5Q8CBA2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Slfn5Q8CBA2 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Slfn5Q8CBA2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Slfn5Q8CBA2 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Slfn5Q8CBA2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Slfn5Q8CBA2 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Slfn5Q8CBA2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Slfn5Q8CBA2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Slfn5Q8CBA2 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Slfn5Q8CBA2 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Slfn5Q8CBA2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Slfn5Q8CBA2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Slfn5Q8CBA2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Slfn5Q8CBA2 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Slfn5Q8CBA2 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Slfn5Q8CBA2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Slfn5Q8CBA2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Slfn5Q8CBA2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Slfn5Q8CBA2 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Slfn5Q8CBA2 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Slfn5Q8CBA2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Slfn5Q8CBA2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Slfn5Q8CBA2 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Slfn5Q8CBA2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Slfn5Q8CBA2 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Slfn5Q8CBA2 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Slfn5Q8CBA2 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Slfn5Q8CBA2 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Slfn5Q8CBA2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Slfn5Q8CBA2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Slfn5Q8CBA2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Slfn5Q8CBA2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Slfn5Q8CBA2 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Slfn5Q8CBA2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Slfn5Q8CBA2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Slfn5Q8CBA2 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Slfn5Q8CBA2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Slfn5Q8CBA2 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Slfn5Q8CBA2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Slfn5Q8CBA2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms