Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atg4aQ8C9S8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atg4aQ8C9S8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atg4aQ8C9S8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atg4aQ8C9S8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atg4aQ8C9S8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atg4aQ8C9S8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atg4aQ8C9S8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atg4aQ8C9S8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atg4aQ8C9S8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atg4aQ8C9S8 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atg4aQ8C9S8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atg4aQ8C9S8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atg4aQ8C9S8 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atg4aQ8C9S8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atg4aQ8C9S8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atg4aQ8C9S8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atg4aQ8C9S8 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atg4aQ8C9S8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atg4aQ8C9S8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Atg4aQ8C9S8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atg4aQ8C9S8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atg4aQ8C9S8 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atg4aQ8C9S8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atg4aQ8C9S8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atg4aQ8C9S8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atg4aQ8C9S8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atg4aQ8C9S8 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atg4aQ8C9S8 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atg4aQ8C9S8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atg4aQ8C9S8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atg4aQ8C9S8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atg4aQ8C9S8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atg4aQ8C9S8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atg4aQ8C9S8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atg4aQ8C9S8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atg4aQ8C9S8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atg4aQ8C9S8 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atg4aQ8C9S8 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Atg4aQ8C9S8 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atg4aQ8C9S8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atg4aQ8C9S8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Atg4aQ8C9S8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atg4aQ8C9S8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atg4aQ8C9S8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atg4aQ8C9S8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atg4aQ8C9S8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atg4aQ8C9S8 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atg4aQ8C9S8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atg4aQ8C9S8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atg4aQ8C9S8 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atg4aQ8C9S8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atg4aQ8C9S8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atg4aQ8C9S8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atg4aQ8C9S8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atg4aQ8C9S8 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Atg4aQ8C9S8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atg4aQ8C9S8 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atg4aQ8C9S8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atg4aQ8C9S8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atg4aQ8C9S8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atg4aQ8C9S8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atg4aQ8C9S8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atg4aQ8C9S8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atg4aQ8C9S8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atg4aQ8C9S8 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atg4aQ8C9S8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Atg4aQ8C9S8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atg4aQ8C9S8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atg4aQ8C9S8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atg4aQ8C9S8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atg4aQ8C9S8 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atg4aQ8C9S8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atg4aQ8C9S8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atg4aQ8C9S8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atg4aQ8C9S8 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atg4aQ8C9S8 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atg4aQ8C9S8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atg4aQ8C9S8 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Atg4aQ8C9S8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atg4aQ8C9S8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atg4aQ8C9S8 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atg4aQ8C9S8 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atg4aQ8C9S8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Atg4aQ8C9S8 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Atg4aQ8C9S8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Atg4aQ8C9S8 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Atg4aQ8C9S8 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Atg4aQ8C9S8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Atg4aQ8C9S8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Atg4aQ8C9S8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Atg4aQ8C9S8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Atg4aQ8C9S8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atg4aQ8C9S8 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atg4aQ8C9S8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atg4aQ8C9S8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atg4aQ8C9S8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atg4aQ8C9S8 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atg4aQ8C9S8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atg4aQ8C9S8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms