Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7M3

Trim9, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM9, mousemouse

Predictions only

Length 817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim9Q8C7M3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim9Q8C7M3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim9Q8C7M3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim9Q8C7M3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim9Q8C7M3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim9Q8C7M3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim9Q8C7M3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim9Q8C7M3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim9Q8C7M3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim9Q8C7M3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim9Q8C7M3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim9Q8C7M3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim9Q8C7M3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim9Q8C7M3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim9Q8C7M3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim9Q8C7M3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim9Q8C7M3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim9Q8C7M3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim9Q8C7M3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim9Q8C7M3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim9Q8C7M3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim9Q8C7M3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim9Q8C7M3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim9Q8C7M3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim9Q8C7M3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim9Q8C7M3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim9Q8C7M3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim9Q8C7M3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim9Q8C7M3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim9Q8C7M3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim9Q8C7M3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim9Q8C7M3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim9Q8C7M3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim9Q8C7M3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim9Q8C7M3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim9Q8C7M3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim9Q8C7M3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim9Q8C7M3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim9Q8C7M3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim9Q8C7M3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim9Q8C7M3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim9Q8C7M3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trim9Q8C7M3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trim9Q8C7M3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trim9Q8C7M3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim9Q8C7M3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim9Q8C7M3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim9Q8C7M3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim9Q8C7M3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim9Q8C7M3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim9Q8C7M3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim9Q8C7M3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim9Q8C7M3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim9Q8C7M3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim9Q8C7M3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim9Q8C7M3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim9Q8C7M3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim9Q8C7M3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim9Q8C7M3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim9Q8C7M3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim9Q8C7M3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim9Q8C7M3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim9Q8C7M3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim9Q8C7M3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim9Q8C7M3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim9Q8C7M3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim9Q8C7M3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim9Q8C7M3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim9Q8C7M3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim9Q8C7M3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim9Q8C7M3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim9Q8C7M3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim9Q8C7M3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim9Q8C7M3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim9Q8C7M3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim9Q8C7M3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim9Q8C7M3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim9Q8C7M3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim9Q8C7M3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim9Q8C7M3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim9Q8C7M3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim9Q8C7M3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim9Q8C7M3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim9Q8C7M3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim9Q8C7M3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim9Q8C7M3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim9Q8C7M3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim9Q8C7M3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim9Q8C7M3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim9Q8C7M3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim9Q8C7M3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim9Q8C7M3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim9Q8C7M3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim9Q8C7M3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim9Q8C7M3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim9Q8C7M3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim9Q8C7M3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim9Q8C7M3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim9Q8C7M3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim9Q8C7M3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms