Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5Z9

4930504O13Rik, RIKEN cDNA 4930504O13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930504O13RikQ8C5Z9 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
4930504O13RikQ8C5Z9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
4930504O13RikQ8C5Z9 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
4930504O13RikQ8C5Z9 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
4930504O13RikQ8C5Z9 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
4930504O13RikQ8C5Z9 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
4930504O13RikQ8C5Z9 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
4930504O13RikQ8C5Z9 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
4930504O13RikQ8C5Z9 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
4930504O13RikQ8C5Z9 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
4930504O13RikQ8C5Z9 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
4930504O13RikQ8C5Z9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
4930504O13RikQ8C5Z9 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
4930504O13RikQ8C5Z9 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
4930504O13RikQ8C5Z9 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
4930504O13RikQ8C5Z9 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
4930504O13RikQ8C5Z9 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
4930504O13RikQ8C5Z9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
4930504O13RikQ8C5Z9 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
4930504O13RikQ8C5Z9 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
4930504O13RikQ8C5Z9 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
4930504O13RikQ8C5Z9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
4930504O13RikQ8C5Z9 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
4930504O13RikQ8C5Z9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
4930504O13RikQ8C5Z9 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
4930504O13RikQ8C5Z9 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
4930504O13RikQ8C5Z9 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
4930504O13RikQ8C5Z9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
4930504O13RikQ8C5Z9 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
4930504O13RikQ8C5Z9 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
4930504O13RikQ8C5Z9 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
4930504O13RikQ8C5Z9 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
4930504O13RikQ8C5Z9 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
4930504O13RikQ8C5Z9 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
4930504O13RikQ8C5Z9 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
4930504O13RikQ8C5Z9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
4930504O13RikQ8C5Z9 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
4930504O13RikQ8C5Z9 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
4930504O13RikQ8C5Z9 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
4930504O13RikQ8C5Z9 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
4930504O13RikQ8C5Z9 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
4930504O13RikQ8C5Z9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
4930504O13RikQ8C5Z9 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
4930504O13RikQ8C5Z9 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
4930504O13RikQ8C5Z9 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
4930504O13RikQ8C5Z9 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
4930504O13RikQ8C5Z9 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
4930504O13RikQ8C5Z9 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
4930504O13RikQ8C5Z9 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
4930504O13RikQ8C5Z9 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
4930504O13RikQ8C5Z9 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
4930504O13RikQ8C5Z9 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
4930504O13RikQ8C5Z9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
4930504O13RikQ8C5Z9 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
4930504O13RikQ8C5Z9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
4930504O13RikQ8C5Z9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
4930504O13RikQ8C5Z9 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
4930504O13RikQ8C5Z9 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
4930504O13RikQ8C5Z9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
4930504O13RikQ8C5Z9 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
4930504O13RikQ8C5Z9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
4930504O13RikQ8C5Z9 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
4930504O13RikQ8C5Z9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
4930504O13RikQ8C5Z9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
4930504O13RikQ8C5Z9 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
4930504O13RikQ8C5Z9 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
4930504O13RikQ8C5Z9 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
4930504O13RikQ8C5Z9 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
4930504O13RikQ8C5Z9 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
4930504O13RikQ8C5Z9 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
4930504O13RikQ8C5Z9 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
4930504O13RikQ8C5Z9 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
4930504O13RikQ8C5Z9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
4930504O13RikQ8C5Z9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
4930504O13RikQ8C5Z9 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
4930504O13RikQ8C5Z9 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
4930504O13RikQ8C5Z9 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
4930504O13RikQ8C5Z9 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
4930504O13RikQ8C5Z9 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
4930504O13RikQ8C5Z9 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
4930504O13RikQ8C5Z9 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
4930504O13RikQ8C5Z9 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
4930504O13RikQ8C5Z9 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
4930504O13RikQ8C5Z9 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
4930504O13RikQ8C5Z9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
4930504O13RikQ8C5Z9 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
4930504O13RikQ8C5Z9 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
4930504O13RikQ8C5Z9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
4930504O13RikQ8C5Z9 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
4930504O13RikQ8C5Z9 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms