Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc113Q8C5T8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc113Q8C5T8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc113Q8C5T8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc113Q8C5T8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc113Q8C5T8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc113Q8C5T8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc113Q8C5T8 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc113Q8C5T8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc113Q8C5T8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc113Q8C5T8 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc113Q8C5T8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc113Q8C5T8 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc113Q8C5T8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc113Q8C5T8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc113Q8C5T8 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc113Q8C5T8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc113Q8C5T8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc113Q8C5T8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc113Q8C5T8 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc113Q8C5T8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc113Q8C5T8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc113Q8C5T8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc113Q8C5T8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc113Q8C5T8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc113Q8C5T8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc113Q8C5T8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc113Q8C5T8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc113Q8C5T8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc113Q8C5T8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc113Q8C5T8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc113Q8C5T8 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc113Q8C5T8 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc113Q8C5T8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc113Q8C5T8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc113Q8C5T8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc113Q8C5T8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc113Q8C5T8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc113Q8C5T8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc113Q8C5T8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc113Q8C5T8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc113Q8C5T8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc113Q8C5T8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc113Q8C5T8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc113Q8C5T8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc113Q8C5T8 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc113Q8C5T8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc113Q8C5T8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc113Q8C5T8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc113Q8C5T8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc113Q8C5T8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc113Q8C5T8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc113Q8C5T8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc113Q8C5T8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc113Q8C5T8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc113Q8C5T8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc113Q8C5T8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc113Q8C5T8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc113Q8C5T8 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc113Q8C5T8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc113Q8C5T8 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc113Q8C5T8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc113Q8C5T8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc113Q8C5T8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc113Q8C5T8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc113Q8C5T8 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc113Q8C5T8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc113Q8C5T8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc113Q8C5T8 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc113Q8C5T8 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc113Q8C5T8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc113Q8C5T8 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc113Q8C5T8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc113Q8C5T8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc113Q8C5T8 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc113Q8C5T8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc113Q8C5T8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc113Q8C5T8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc113Q8C5T8 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc113Q8C5T8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc113Q8C5T8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc113Q8C5T8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc113Q8C5T8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc113Q8C5T8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc113Q8C5T8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc113Q8C5T8 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc113Q8C5T8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc113Q8C5T8 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc113Q8C5T8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc113Q8C5T8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc113Q8C5T8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc113Q8C5T8 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc113Q8C5T8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc113Q8C5T8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc113Q8C5T8 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc113Q8C5T8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc113Q8C5T8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc113Q8C5T8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc113Q8C5T8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc113Q8C5T8 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
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