Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccser1Q8C0C4 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccser1Q8C0C4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccser1Q8C0C4 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccser1Q8C0C4 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccser1Q8C0C4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccser1Q8C0C4 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccser1Q8C0C4 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccser1Q8C0C4 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccser1Q8C0C4 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccser1Q8C0C4 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccser1Q8C0C4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccser1Q8C0C4 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccser1Q8C0C4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccser1Q8C0C4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccser1Q8C0C4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccser1Q8C0C4 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccser1Q8C0C4 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccser1Q8C0C4 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccser1Q8C0C4 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccser1Q8C0C4 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccser1Q8C0C4 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccser1Q8C0C4 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccser1Q8C0C4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccser1Q8C0C4 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccser1Q8C0C4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccser1Q8C0C4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccser1Q8C0C4 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccser1Q8C0C4 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccser1Q8C0C4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccser1Q8C0C4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccser1Q8C0C4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccser1Q8C0C4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccser1Q8C0C4 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccser1Q8C0C4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccser1Q8C0C4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccser1Q8C0C4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccser1Q8C0C4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccser1Q8C0C4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccser1Q8C0C4 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccser1Q8C0C4 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccser1Q8C0C4 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccser1Q8C0C4 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccser1Q8C0C4 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccser1Q8C0C4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccser1Q8C0C4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccser1Q8C0C4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccser1Q8C0C4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccser1Q8C0C4 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccser1Q8C0C4 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccser1Q8C0C4 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccser1Q8C0C4 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccser1Q8C0C4 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccser1Q8C0C4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccser1Q8C0C4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccser1Q8C0C4 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccser1Q8C0C4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccser1Q8C0C4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccser1Q8C0C4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccser1Q8C0C4 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccser1Q8C0C4 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccser1Q8C0C4 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccser1Q8C0C4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccser1Q8C0C4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccser1Q8C0C4 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccser1Q8C0C4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccser1Q8C0C4 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccser1Q8C0C4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccser1Q8C0C4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccser1Q8C0C4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccser1Q8C0C4 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccser1Q8C0C4 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccser1Q8C0C4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccser1Q8C0C4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccser1Q8C0C4 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccser1Q8C0C4 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccser1Q8C0C4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccser1Q8C0C4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccser1Q8C0C4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccser1Q8C0C4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccser1Q8C0C4 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccser1Q8C0C4 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccser1Q8C0C4 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccser1Q8C0C4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccser1Q8C0C4 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccser1Q8C0C4 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccser1Q8C0C4 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccser1Q8C0C4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccser1Q8C0C4 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccser1Q8C0C4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccser1Q8C0C4 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccser1Q8C0C4 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccser1Q8C0C4 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccser1Q8C0C4 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccser1Q8C0C4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccser1Q8C0C4 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccser1Q8C0C4 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccser1Q8C0C4 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccser1Q8C0C4 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccser1Q8C0C4 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
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