Protein–RNA interactions for Protein: Q8BYH8

Chd9, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 2,885 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd9Q8BYH8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chd9Q8BYH8 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chd9Q8BYH8 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chd9Q8BYH8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chd9Q8BYH8 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chd9Q8BYH8 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chd9Q8BYH8 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chd9Q8BYH8 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chd9Q8BYH8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chd9Q8BYH8 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chd9Q8BYH8 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chd9Q8BYH8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chd9Q8BYH8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Chd9Q8BYH8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chd9Q8BYH8 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chd9Q8BYH8 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chd9Q8BYH8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chd9Q8BYH8 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chd9Q8BYH8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chd9Q8BYH8 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chd9Q8BYH8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chd9Q8BYH8 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Chd9Q8BYH8 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chd9Q8BYH8 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chd9Q8BYH8 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chd9Q8BYH8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chd9Q8BYH8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chd9Q8BYH8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chd9Q8BYH8 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Chd9Q8BYH8 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chd9Q8BYH8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chd9Q8BYH8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chd9Q8BYH8 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chd9Q8BYH8 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chd9Q8BYH8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chd9Q8BYH8 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chd9Q8BYH8 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chd9Q8BYH8 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chd9Q8BYH8 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chd9Q8BYH8 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chd9Q8BYH8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chd9Q8BYH8 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Chd9Q8BYH8 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
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Chd9Q8BYH8 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chd9Q8BYH8 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Chd9Q8BYH8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Chd9Q8BYH8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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Chd9Q8BYH8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chd9Q8BYH8 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chd9Q8BYH8 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16■□□□□ 0.15
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Chd9Q8BYH8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chd9Q8BYH8 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chd9Q8BYH8 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chd9Q8BYH8 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chd9Q8BYH8 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chd9Q8BYH8 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chd9Q8BYH8 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chd9Q8BYH8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Chd9Q8BYH8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chd9Q8BYH8 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Chd9Q8BYH8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chd9Q8BYH8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chd9Q8BYH8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chd9Q8BYH8 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Chd9Q8BYH8 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chd9Q8BYH8 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chd9Q8BYH8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chd9Q8BYH8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Chd9Q8BYH8 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd9Q8BYH8 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd9Q8BYH8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd9Q8BYH8 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd9Q8BYH8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd9Q8BYH8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd9Q8BYH8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd9Q8BYH8 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd9Q8BYH8 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd9Q8BYH8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd9Q8BYH8 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd9Q8BYH8 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd9Q8BYH8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd9Q8BYH8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd9Q8BYH8 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd9Q8BYH8 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd9Q8BYH8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd9Q8BYH8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd9Q8BYH8 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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