Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXS2

Tnfsfm13, Tumor necrosis factor (ligand) superfamily, membrane-bound member 13, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsfm13Q8BXS2 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfsfm13Q8BXS2 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfsfm13Q8BXS2 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfsfm13Q8BXS2 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfsfm13Q8BXS2 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfsfm13Q8BXS2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfsfm13Q8BXS2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnfsfm13Q8BXS2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnfsfm13Q8BXS2 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnfsfm13Q8BXS2 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnfsfm13Q8BXS2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnfsfm13Q8BXS2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnfsfm13Q8BXS2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnfsfm13Q8BXS2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnfsfm13Q8BXS2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnfsfm13Q8BXS2 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnfsfm13Q8BXS2 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnfsfm13Q8BXS2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnfsfm13Q8BXS2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnfsfm13Q8BXS2 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnfsfm13Q8BXS2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tnfsfm13Q8BXS2 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tnfsfm13Q8BXS2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tnfsfm13Q8BXS2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnfsfm13Q8BXS2 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnfsfm13Q8BXS2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnfsfm13Q8BXS2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnfsfm13Q8BXS2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnfsfm13Q8BXS2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnfsfm13Q8BXS2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnfsfm13Q8BXS2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnfsfm13Q8BXS2 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnfsfm13Q8BXS2 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnfsfm13Q8BXS2 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnfsfm13Q8BXS2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnfsfm13Q8BXS2 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnfsfm13Q8BXS2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnfsfm13Q8BXS2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnfsfm13Q8BXS2 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnfsfm13Q8BXS2 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnfsfm13Q8BXS2 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnfsfm13Q8BXS2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnfsfm13Q8BXS2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnfsfm13Q8BXS2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnfsfm13Q8BXS2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnfsfm13Q8BXS2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnfsfm13Q8BXS2 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnfsfm13Q8BXS2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnfsfm13Q8BXS2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnfsfm13Q8BXS2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnfsfm13Q8BXS2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnfsfm13Q8BXS2 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnfsfm13Q8BXS2 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnfsfm13Q8BXS2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnfsfm13Q8BXS2 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnfsfm13Q8BXS2 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnfsfm13Q8BXS2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnfsfm13Q8BXS2 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnfsfm13Q8BXS2 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnfsfm13Q8BXS2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnfsfm13Q8BXS2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnfsfm13Q8BXS2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnfsfm13Q8BXS2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnfsfm13Q8BXS2 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnfsfm13Q8BXS2 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnfsfm13Q8BXS2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnfsfm13Q8BXS2 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnfsfm13Q8BXS2 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnfsfm13Q8BXS2 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnfsfm13Q8BXS2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnfsfm13Q8BXS2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnfsfm13Q8BXS2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnfsfm13Q8BXS2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnfsfm13Q8BXS2 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnfsfm13Q8BXS2 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnfsfm13Q8BXS2 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnfsfm13Q8BXS2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnfsfm13Q8BXS2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnfsfm13Q8BXS2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnfsfm13Q8BXS2 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnfsfm13Q8BXS2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnfsfm13Q8BXS2 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnfsfm13Q8BXS2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnfsfm13Q8BXS2 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnfsfm13Q8BXS2 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnfsfm13Q8BXS2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnfsfm13Q8BXS2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnfsfm13Q8BXS2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnfsfm13Q8BXS2 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnfsfm13Q8BXS2 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnfsfm13Q8BXS2 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnfsfm13Q8BXS2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnfsfm13Q8BXS2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms