Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXL7

Arfrp1, ADP-ribosylation factor-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfrp1Q8BXL7 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Arfrp1Q8BXL7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Arfrp1Q8BXL7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Arfrp1Q8BXL7 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Arfrp1Q8BXL7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Arfrp1Q8BXL7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Arfrp1Q8BXL7 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Arfrp1Q8BXL7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Arfrp1Q8BXL7 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Arfrp1Q8BXL7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Arfrp1Q8BXL7 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Arfrp1Q8BXL7 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Arfrp1Q8BXL7 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Arfrp1Q8BXL7 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Arfrp1Q8BXL7 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Arfrp1Q8BXL7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Arfrp1Q8BXL7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Arfrp1Q8BXL7 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Arfrp1Q8BXL7 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Arfrp1Q8BXL7 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Arfrp1Q8BXL7 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Arfrp1Q8BXL7 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Arfrp1Q8BXL7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Arfrp1Q8BXL7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Arfrp1Q8BXL7 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Arfrp1Q8BXL7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Arfrp1Q8BXL7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Arfrp1Q8BXL7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Arfrp1Q8BXL7 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Arfrp1Q8BXL7 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Arfrp1Q8BXL7 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Arfrp1Q8BXL7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Arfrp1Q8BXL7 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Arfrp1Q8BXL7 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Arfrp1Q8BXL7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Arfrp1Q8BXL7 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Arfrp1Q8BXL7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Arfrp1Q8BXL7 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Arfrp1Q8BXL7 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Arfrp1Q8BXL7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Arfrp1Q8BXL7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Arfrp1Q8BXL7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Arfrp1Q8BXL7 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Arfrp1Q8BXL7 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Arfrp1Q8BXL7 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Arfrp1Q8BXL7 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Arfrp1Q8BXL7 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Arfrp1Q8BXL7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Arfrp1Q8BXL7 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Arfrp1Q8BXL7 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Arfrp1Q8BXL7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Arfrp1Q8BXL7 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Arfrp1Q8BXL7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Arfrp1Q8BXL7 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Arfrp1Q8BXL7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Arfrp1Q8BXL7 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Arfrp1Q8BXL7 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Arfrp1Q8BXL7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Arfrp1Q8BXL7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Arfrp1Q8BXL7 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Arfrp1Q8BXL7 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Arfrp1Q8BXL7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Arfrp1Q8BXL7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Arfrp1Q8BXL7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Arfrp1Q8BXL7 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Arfrp1Q8BXL7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Arfrp1Q8BXL7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Arfrp1Q8BXL7 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Arfrp1Q8BXL7 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Arfrp1Q8BXL7 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Arfrp1Q8BXL7 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arfrp1Q8BXL7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arfrp1Q8BXL7 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arfrp1Q8BXL7 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arfrp1Q8BXL7 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arfrp1Q8BXL7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arfrp1Q8BXL7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arfrp1Q8BXL7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arfrp1Q8BXL7 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arfrp1Q8BXL7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arfrp1Q8BXL7 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arfrp1Q8BXL7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Arfrp1Q8BXL7 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arfrp1Q8BXL7 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Arfrp1Q8BXL7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Arfrp1Q8BXL7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Arfrp1Q8BXL7 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Arfrp1Q8BXL7 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Arfrp1Q8BXL7 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Arfrp1Q8BXL7 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Arfrp1Q8BXL7 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Arfrp1Q8BXL7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Arfrp1Q8BXL7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Arfrp1Q8BXL7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Arfrp1Q8BXL7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Arfrp1Q8BXL7 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Arfrp1Q8BXL7 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Arfrp1Q8BXL7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Arfrp1Q8BXL7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Arfrp1Q8BXL7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 211.2 ms