Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX22

Sall4, Sal-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,067 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall4Q8BX22 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sall4Q8BX22 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sall4Q8BX22 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sall4Q8BX22 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sall4Q8BX22 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sall4Q8BX22 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sall4Q8BX22 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sall4Q8BX22 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sall4Q8BX22 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sall4Q8BX22 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sall4Q8BX22 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sall4Q8BX22 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sall4Q8BX22 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sall4Q8BX22 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sall4Q8BX22 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sall4Q8BX22 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sall4Q8BX22 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sall4Q8BX22 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sall4Q8BX22 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sall4Q8BX22 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sall4Q8BX22 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Sall4Q8BX22 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sall4Q8BX22 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sall4Q8BX22 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sall4Q8BX22 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sall4Q8BX22 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sall4Q8BX22 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sall4Q8BX22 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sall4Q8BX22 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Sall4Q8BX22 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sall4Q8BX22 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sall4Q8BX22 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sall4Q8BX22 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sall4Q8BX22 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sall4Q8BX22 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sall4Q8BX22 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sall4Q8BX22 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sall4Q8BX22 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sall4Q8BX22 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sall4Q8BX22 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sall4Q8BX22 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sall4Q8BX22 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sall4Q8BX22 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sall4Q8BX22 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sall4Q8BX22 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sall4Q8BX22 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sall4Q8BX22 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sall4Q8BX22 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sall4Q8BX22 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sall4Q8BX22 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sall4Q8BX22 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sall4Q8BX22 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sall4Q8BX22 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sall4Q8BX22 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sall4Q8BX22 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Sall4Q8BX22 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sall4Q8BX22 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sall4Q8BX22 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sall4Q8BX22 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sall4Q8BX22 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sall4Q8BX22 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sall4Q8BX22 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sall4Q8BX22 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sall4Q8BX22 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sall4Q8BX22 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sall4Q8BX22 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sall4Q8BX22 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sall4Q8BX22 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sall4Q8BX22 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sall4Q8BX22 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sall4Q8BX22 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sall4Q8BX22 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sall4Q8BX22 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sall4Q8BX22 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sall4Q8BX22 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sall4Q8BX22 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sall4Q8BX22 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sall4Q8BX22 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Sall4Q8BX22 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sall4Q8BX22 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sall4Q8BX22 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sall4Q8BX22 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Sall4Q8BX22 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Sall4Q8BX22 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Sall4Q8BX22 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sall4Q8BX22 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sall4Q8BX22 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sall4Q8BX22 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sall4Q8BX22 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sall4Q8BX22 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Sall4Q8BX22 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Sall4Q8BX22 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Sall4Q8BX22 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sall4Q8BX22 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sall4Q8BX22 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sall4Q8BX22 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Sall4Q8BX22 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sall4Q8BX22 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sall4Q8BX22 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sall4Q8BX22 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms