Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX10

Pgam5, Serine/threonine-protein phosphatase PGAM5, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgam5Q8BX10 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pgam5Q8BX10 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pgam5Q8BX10 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pgam5Q8BX10 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pgam5Q8BX10 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pgam5Q8BX10 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pgam5Q8BX10 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pgam5Q8BX10 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pgam5Q8BX10 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pgam5Q8BX10 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pgam5Q8BX10 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pgam5Q8BX10 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pgam5Q8BX10 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pgam5Q8BX10 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pgam5Q8BX10 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pgam5Q8BX10 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pgam5Q8BX10 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pgam5Q8BX10 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pgam5Q8BX10 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pgam5Q8BX10 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pgam5Q8BX10 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pgam5Q8BX10 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pgam5Q8BX10 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pgam5Q8BX10 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pgam5Q8BX10 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pgam5Q8BX10 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pgam5Q8BX10 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pgam5Q8BX10 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pgam5Q8BX10 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Pgam5Q8BX10 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pgam5Q8BX10 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pgam5Q8BX10 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pgam5Q8BX10 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pgam5Q8BX10 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pgam5Q8BX10 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pgam5Q8BX10 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pgam5Q8BX10 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pgam5Q8BX10 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pgam5Q8BX10 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pgam5Q8BX10 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pgam5Q8BX10 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pgam5Q8BX10 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pgam5Q8BX10 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pgam5Q8BX10 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pgam5Q8BX10 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pgam5Q8BX10 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pgam5Q8BX10 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pgam5Q8BX10 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pgam5Q8BX10 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pgam5Q8BX10 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pgam5Q8BX10 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pgam5Q8BX10 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pgam5Q8BX10 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pgam5Q8BX10 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pgam5Q8BX10 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pgam5Q8BX10 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pgam5Q8BX10 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pgam5Q8BX10 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pgam5Q8BX10 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pgam5Q8BX10 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pgam5Q8BX10 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Pgam5Q8BX10 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pgam5Q8BX10 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pgam5Q8BX10 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pgam5Q8BX10 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pgam5Q8BX10 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pgam5Q8BX10 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pgam5Q8BX10 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pgam5Q8BX10 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pgam5Q8BX10 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pgam5Q8BX10 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pgam5Q8BX10 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pgam5Q8BX10 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pgam5Q8BX10 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pgam5Q8BX10 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pgam5Q8BX10 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pgam5Q8BX10 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pgam5Q8BX10 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pgam5Q8BX10 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pgam5Q8BX10 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pgam5Q8BX10 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pgam5Q8BX10 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pgam5Q8BX10 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pgam5Q8BX10 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pgam5Q8BX10 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pgam5Q8BX10 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pgam5Q8BX10 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pgam5Q8BX10 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pgam5Q8BX10 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pgam5Q8BX10 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pgam5Q8BX10 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pgam5Q8BX10 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pgam5Q8BX10 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pgam5Q8BX10 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pgam5Q8BX10 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pgam5Q8BX10 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pgam5Q8BX10 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pgam5Q8BX10 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pgam5Q8BX10 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pgam5Q8BX10 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms