Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rbbp5Q8BX09 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rbbp5Q8BX09 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Rbbp5Q8BX09 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rbbp5Q8BX09 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rbbp5Q8BX09 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rbbp5Q8BX09 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rbbp5Q8BX09 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rbbp5Q8BX09 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rbbp5Q8BX09 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rbbp5Q8BX09 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rbbp5Q8BX09 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rbbp5Q8BX09 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rbbp5Q8BX09 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rbbp5Q8BX09 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rbbp5Q8BX09 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rbbp5Q8BX09 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rbbp5Q8BX09 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rbbp5Q8BX09 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rbbp5Q8BX09 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rbbp5Q8BX09 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rbbp5Q8BX09 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rbbp5Q8BX09 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rbbp5Q8BX09 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rbbp5Q8BX09 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rbbp5Q8BX09 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rbbp5Q8BX09 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rbbp5Q8BX09 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rbbp5Q8BX09 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rbbp5Q8BX09 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rbbp5Q8BX09 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rbbp5Q8BX09 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rbbp5Q8BX09 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rbbp5Q8BX09 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rbbp5Q8BX09 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Rbbp5Q8BX09 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rbbp5Q8BX09 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rbbp5Q8BX09 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rbbp5Q8BX09 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rbbp5Q8BX09 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rbbp5Q8BX09 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rbbp5Q8BX09 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rbbp5Q8BX09 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rbbp5Q8BX09 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rbbp5Q8BX09 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Rbbp5Q8BX09 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rbbp5Q8BX09 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rbbp5Q8BX09 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rbbp5Q8BX09 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rbbp5Q8BX09 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rbbp5Q8BX09 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rbbp5Q8BX09 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rbbp5Q8BX09 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rbbp5Q8BX09 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rbbp5Q8BX09 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rbbp5Q8BX09 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rbbp5Q8BX09 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rbbp5Q8BX09 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rbbp5Q8BX09 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rbbp5Q8BX09 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rbbp5Q8BX09 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rbbp5Q8BX09 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rbbp5Q8BX09 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rbbp5Q8BX09 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rbbp5Q8BX09 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rbbp5Q8BX09 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rbbp5Q8BX09 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rbbp5Q8BX09 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rbbp5Q8BX09 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rbbp5Q8BX09 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rbbp5Q8BX09 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rbbp5Q8BX09 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rbbp5Q8BX09 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rbbp5Q8BX09 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rbbp5Q8BX09 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rbbp5Q8BX09 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rbbp5Q8BX09 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rbbp5Q8BX09 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Rbbp5Q8BX09 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rbbp5Q8BX09 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rbbp5Q8BX09 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rbbp5Q8BX09 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rbbp5Q8BX09 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rbbp5Q8BX09 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rbbp5Q8BX09 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rbbp5Q8BX09 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rbbp5Q8BX09 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rbbp5Q8BX09 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rbbp5Q8BX09 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Rbbp5Q8BX09 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rbbp5Q8BX09 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rbbp5Q8BX09 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rbbp5Q8BX09 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rbbp5Q8BX09 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rbbp5Q8BX09 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rbbp5Q8BX09 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rbbp5Q8BX09 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rbbp5Q8BX09 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rbbp5Q8BX09 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rbbp5Q8BX09 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms