Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVP1

Triml1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIML1, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Triml1Q8BVP1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Triml1Q8BVP1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Triml1Q8BVP1 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Triml1Q8BVP1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Triml1Q8BVP1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Triml1Q8BVP1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Triml1Q8BVP1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Triml1Q8BVP1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Triml1Q8BVP1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Triml1Q8BVP1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Triml1Q8BVP1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Triml1Q8BVP1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Triml1Q8BVP1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Triml1Q8BVP1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Triml1Q8BVP1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Triml1Q8BVP1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Triml1Q8BVP1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Triml1Q8BVP1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Triml1Q8BVP1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Triml1Q8BVP1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Triml1Q8BVP1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Triml1Q8BVP1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Triml1Q8BVP1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Triml1Q8BVP1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Triml1Q8BVP1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Triml1Q8BVP1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Triml1Q8BVP1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Triml1Q8BVP1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Triml1Q8BVP1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Triml1Q8BVP1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Triml1Q8BVP1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Triml1Q8BVP1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Triml1Q8BVP1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Triml1Q8BVP1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Triml1Q8BVP1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Triml1Q8BVP1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Triml1Q8BVP1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Triml1Q8BVP1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Triml1Q8BVP1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Triml1Q8BVP1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Triml1Q8BVP1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Triml1Q8BVP1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Triml1Q8BVP1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Triml1Q8BVP1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Triml1Q8BVP1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Triml1Q8BVP1 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Triml1Q8BVP1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Triml1Q8BVP1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Triml1Q8BVP1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Triml1Q8BVP1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Triml1Q8BVP1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Triml1Q8BVP1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Triml1Q8BVP1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Triml1Q8BVP1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Triml1Q8BVP1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Triml1Q8BVP1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Triml1Q8BVP1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Triml1Q8BVP1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Triml1Q8BVP1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Triml1Q8BVP1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Triml1Q8BVP1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Triml1Q8BVP1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Triml1Q8BVP1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Triml1Q8BVP1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Triml1Q8BVP1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Triml1Q8BVP1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Triml1Q8BVP1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Triml1Q8BVP1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Triml1Q8BVP1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Triml1Q8BVP1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Triml1Q8BVP1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Triml1Q8BVP1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Triml1Q8BVP1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Triml1Q8BVP1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Triml1Q8BVP1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Triml1Q8BVP1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Triml1Q8BVP1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Triml1Q8BVP1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Triml1Q8BVP1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Triml1Q8BVP1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Triml1Q8BVP1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Triml1Q8BVP1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Triml1Q8BVP1 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Triml1Q8BVP1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Triml1Q8BVP1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Triml1Q8BVP1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Triml1Q8BVP1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Triml1Q8BVP1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Triml1Q8BVP1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Triml1Q8BVP1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Triml1Q8BVP1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Triml1Q8BVP1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Triml1Q8BVP1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Triml1Q8BVP1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Triml1Q8BVP1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Triml1Q8BVP1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Triml1Q8BVP1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Triml1Q8BVP1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Triml1Q8BVP1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Triml1Q8BVP1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms