Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV57

Ssc5d, Soluble scavenger receptor cysteine-rich domain-containing protein SSC5D, mousemouse

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Length 1,371 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssc5dQ8BV57 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ssc5dQ8BV57 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ssc5dQ8BV57 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Ssc5dQ8BV57 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ssc5dQ8BV57 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ssc5dQ8BV57 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ssc5dQ8BV57 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ssc5dQ8BV57 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ssc5dQ8BV57 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ssc5dQ8BV57 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ssc5dQ8BV57 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ssc5dQ8BV57 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ssc5dQ8BV57 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ssc5dQ8BV57 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ssc5dQ8BV57 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ssc5dQ8BV57 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ssc5dQ8BV57 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ssc5dQ8BV57 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ssc5dQ8BV57 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ssc5dQ8BV57 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ssc5dQ8BV57 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Ssc5dQ8BV57 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ssc5dQ8BV57 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ssc5dQ8BV57 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ssc5dQ8BV57 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ssc5dQ8BV57 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ssc5dQ8BV57 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ssc5dQ8BV57 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ssc5dQ8BV57 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ssc5dQ8BV57 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ssc5dQ8BV57 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ssc5dQ8BV57 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ssc5dQ8BV57 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ssc5dQ8BV57 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ssc5dQ8BV57 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ssc5dQ8BV57 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ssc5dQ8BV57 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ssc5dQ8BV57 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ssc5dQ8BV57 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ssc5dQ8BV57 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ssc5dQ8BV57 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ssc5dQ8BV57 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ssc5dQ8BV57 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ssc5dQ8BV57 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ssc5dQ8BV57 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ssc5dQ8BV57 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ssc5dQ8BV57 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ssc5dQ8BV57 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.56
Ssc5dQ8BV57 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ssc5dQ8BV57 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ssc5dQ8BV57 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Ssc5dQ8BV57 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ssc5dQ8BV57 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ssc5dQ8BV57 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ssc5dQ8BV57 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ssc5dQ8BV57 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ssc5dQ8BV57 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ssc5dQ8BV57 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Ssc5dQ8BV57 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ssc5dQ8BV57 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ssc5dQ8BV57 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ssc5dQ8BV57 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ssc5dQ8BV57 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ssc5dQ8BV57 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ssc5dQ8BV57 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ssc5dQ8BV57 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ssc5dQ8BV57 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ssc5dQ8BV57 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ssc5dQ8BV57 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ssc5dQ8BV57 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ssc5dQ8BV57 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ssc5dQ8BV57 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ssc5dQ8BV57 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ssc5dQ8BV57 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Ssc5dQ8BV57 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ssc5dQ8BV57 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ssc5dQ8BV57 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ssc5dQ8BV57 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ssc5dQ8BV57 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ssc5dQ8BV57 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ssc5dQ8BV57 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ssc5dQ8BV57 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ssc5dQ8BV57 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ssc5dQ8BV57 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ssc5dQ8BV57 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ssc5dQ8BV57 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ssc5dQ8BV57 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ssc5dQ8BV57 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Ssc5dQ8BV57 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Ssc5dQ8BV57 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ssc5dQ8BV57 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ssc5dQ8BV57 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ssc5dQ8BV57 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ssc5dQ8BV57 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ssc5dQ8BV57 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ssc5dQ8BV57 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ssc5dQ8BV57 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ssc5dQ8BV57 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ssc5dQ8BV57 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Ssc5dQ8BV57 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
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