Protein–RNA interactions for Protein: Q8BN59

Larp6, La-related protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Larp6Q8BN59 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Larp6Q8BN59 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Larp6Q8BN59 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Larp6Q8BN59 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Larp6Q8BN59 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Larp6Q8BN59 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Larp6Q8BN59 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Larp6Q8BN59 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Larp6Q8BN59 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Larp6Q8BN59 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Larp6Q8BN59 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Larp6Q8BN59 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Larp6Q8BN59 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Larp6Q8BN59 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Larp6Q8BN59 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Larp6Q8BN59 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Larp6Q8BN59 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Larp6Q8BN59 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Larp6Q8BN59 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Larp6Q8BN59 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Larp6Q8BN59 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Larp6Q8BN59 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Larp6Q8BN59 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Larp6Q8BN59 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Larp6Q8BN59 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Larp6Q8BN59 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Larp6Q8BN59 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Larp6Q8BN59 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Larp6Q8BN59 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Larp6Q8BN59 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Larp6Q8BN59 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Larp6Q8BN59 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Larp6Q8BN59 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Larp6Q8BN59 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Larp6Q8BN59 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Larp6Q8BN59 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Larp6Q8BN59 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Larp6Q8BN59 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Larp6Q8BN59 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Larp6Q8BN59 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Larp6Q8BN59 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Larp6Q8BN59 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Larp6Q8BN59 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Larp6Q8BN59 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Larp6Q8BN59 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Larp6Q8BN59 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Larp6Q8BN59 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Larp6Q8BN59 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Larp6Q8BN59 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Larp6Q8BN59 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Larp6Q8BN59 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Larp6Q8BN59 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Larp6Q8BN59 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Larp6Q8BN59 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Larp6Q8BN59 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Larp6Q8BN59 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Larp6Q8BN59 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Larp6Q8BN59 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Larp6Q8BN59 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Larp6Q8BN59 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Larp6Q8BN59 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Larp6Q8BN59 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Larp6Q8BN59 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Larp6Q8BN59 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Larp6Q8BN59 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Larp6Q8BN59 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Larp6Q8BN59 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Larp6Q8BN59 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Larp6Q8BN59 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Larp6Q8BN59 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Larp6Q8BN59 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Larp6Q8BN59 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Larp6Q8BN59 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Larp6Q8BN59 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Larp6Q8BN59 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Larp6Q8BN59 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Larp6Q8BN59 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Larp6Q8BN59 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Larp6Q8BN59 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Larp6Q8BN59 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Larp6Q8BN59 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Larp6Q8BN59 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Larp6Q8BN59 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Larp6Q8BN59 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Larp6Q8BN59 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Larp6Q8BN59 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Larp6Q8BN59 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Larp6Q8BN59 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Larp6Q8BN59 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Larp6Q8BN59 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Larp6Q8BN59 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Larp6Q8BN59 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Larp6Q8BN59 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Larp6Q8BN59 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Larp6Q8BN59 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Larp6Q8BN59 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Larp6Q8BN59 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Larp6Q8BN59 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Larp6Q8BN59 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Larp6Q8BN59 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms