Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gga3Q8BMI3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gga3Q8BMI3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gga3Q8BMI3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Gga3Q8BMI3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Gga3Q8BMI3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gga3Q8BMI3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gga3Q8BMI3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gga3Q8BMI3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gga3Q8BMI3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gga3Q8BMI3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gga3Q8BMI3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gga3Q8BMI3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gga3Q8BMI3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gga3Q8BMI3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gga3Q8BMI3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gga3Q8BMI3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gga3Q8BMI3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gga3Q8BMI3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gga3Q8BMI3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gga3Q8BMI3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gga3Q8BMI3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gga3Q8BMI3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gga3Q8BMI3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gga3Q8BMI3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gga3Q8BMI3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gga3Q8BMI3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gga3Q8BMI3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gga3Q8BMI3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gga3Q8BMI3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gga3Q8BMI3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gga3Q8BMI3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gga3Q8BMI3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gga3Q8BMI3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gga3Q8BMI3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gga3Q8BMI3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gga3Q8BMI3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gga3Q8BMI3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gga3Q8BMI3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gga3Q8BMI3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gga3Q8BMI3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gga3Q8BMI3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gga3Q8BMI3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gga3Q8BMI3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gga3Q8BMI3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Gga3Q8BMI3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gga3Q8BMI3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gga3Q8BMI3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gga3Q8BMI3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gga3Q8BMI3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gga3Q8BMI3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gga3Q8BMI3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gga3Q8BMI3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gga3Q8BMI3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gga3Q8BMI3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gga3Q8BMI3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gga3Q8BMI3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Gga3Q8BMI3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gga3Q8BMI3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gga3Q8BMI3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gga3Q8BMI3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gga3Q8BMI3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gga3Q8BMI3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gga3Q8BMI3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gga3Q8BMI3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gga3Q8BMI3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gga3Q8BMI3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gga3Q8BMI3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gga3Q8BMI3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Gga3Q8BMI3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gga3Q8BMI3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gga3Q8BMI3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Gga3Q8BMI3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gga3Q8BMI3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gga3Q8BMI3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gga3Q8BMI3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gga3Q8BMI3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gga3Q8BMI3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gga3Q8BMI3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gga3Q8BMI3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gga3Q8BMI3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gga3Q8BMI3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gga3Q8BMI3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gga3Q8BMI3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gga3Q8BMI3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gga3Q8BMI3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Gga3Q8BMI3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gga3Q8BMI3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gga3Q8BMI3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gga3Q8BMI3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gga3Q8BMI3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gga3Q8BMI3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gga3Q8BMI3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gga3Q8BMI3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gga3Q8BMI3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gga3Q8BMI3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gga3Q8BMI3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gga3Q8BMI3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gga3Q8BMI3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gga3Q8BMI3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms