Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIG4

Fbxo28, F-box only protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo28Q8BIG4 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fbxo28Q8BIG4 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fbxo28Q8BIG4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fbxo28Q8BIG4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fbxo28Q8BIG4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fbxo28Q8BIG4 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fbxo28Q8BIG4 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fbxo28Q8BIG4 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Fbxo28Q8BIG4 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fbxo28Q8BIG4 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fbxo28Q8BIG4 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fbxo28Q8BIG4 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Fbxo28Q8BIG4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Fbxo28Q8BIG4 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fbxo28Q8BIG4 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fbxo28Q8BIG4 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fbxo28Q8BIG4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fbxo28Q8BIG4 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fbxo28Q8BIG4 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fbxo28Q8BIG4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fbxo28Q8BIG4 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fbxo28Q8BIG4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Fbxo28Q8BIG4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fbxo28Q8BIG4 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fbxo28Q8BIG4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fbxo28Q8BIG4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fbxo28Q8BIG4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fbxo28Q8BIG4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fbxo28Q8BIG4 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fbxo28Q8BIG4 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Fbxo28Q8BIG4 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fbxo28Q8BIG4 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fbxo28Q8BIG4 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fbxo28Q8BIG4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fbxo28Q8BIG4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fbxo28Q8BIG4 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fbxo28Q8BIG4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fbxo28Q8BIG4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fbxo28Q8BIG4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fbxo28Q8BIG4 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fbxo28Q8BIG4 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Fbxo28Q8BIG4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fbxo28Q8BIG4 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fbxo28Q8BIG4 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Fbxo28Q8BIG4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fbxo28Q8BIG4 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fbxo28Q8BIG4 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fbxo28Q8BIG4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fbxo28Q8BIG4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fbxo28Q8BIG4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fbxo28Q8BIG4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fbxo28Q8BIG4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Fbxo28Q8BIG4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fbxo28Q8BIG4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fbxo28Q8BIG4 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fbxo28Q8BIG4 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fbxo28Q8BIG4 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fbxo28Q8BIG4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fbxo28Q8BIG4 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fbxo28Q8BIG4 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fbxo28Q8BIG4 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fbxo28Q8BIG4 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fbxo28Q8BIG4 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fbxo28Q8BIG4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fbxo28Q8BIG4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fbxo28Q8BIG4 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fbxo28Q8BIG4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fbxo28Q8BIG4 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fbxo28Q8BIG4 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fbxo28Q8BIG4 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fbxo28Q8BIG4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fbxo28Q8BIG4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fbxo28Q8BIG4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Fbxo28Q8BIG4 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Fbxo28Q8BIG4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fbxo28Q8BIG4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Fbxo28Q8BIG4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fbxo28Q8BIG4 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fbxo28Q8BIG4 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fbxo28Q8BIG4 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Fbxo28Q8BIG4 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fbxo28Q8BIG4 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fbxo28Q8BIG4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fbxo28Q8BIG4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fbxo28Q8BIG4 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fbxo28Q8BIG4 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fbxo28Q8BIG4 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fbxo28Q8BIG4 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fbxo28Q8BIG4 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fbxo28Q8BIG4 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fbxo28Q8BIG4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fbxo28Q8BIG4 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fbxo28Q8BIG4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fbxo28Q8BIG4 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fbxo28Q8BIG4 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fbxo28Q8BIG4 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fbxo28Q8BIG4 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fbxo28Q8BIG4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fbxo28Q8BIG4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fbxo28Q8BIG4 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms