Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGW8

Vgll2, Transcription cofactor vestigial-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll2Q8BGW8 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vgll2Q8BGW8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Vgll2Q8BGW8 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vgll2Q8BGW8 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vgll2Q8BGW8 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vgll2Q8BGW8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vgll2Q8BGW8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vgll2Q8BGW8 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vgll2Q8BGW8 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vgll2Q8BGW8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vgll2Q8BGW8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vgll2Q8BGW8 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vgll2Q8BGW8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vgll2Q8BGW8 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vgll2Q8BGW8 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vgll2Q8BGW8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vgll2Q8BGW8 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vgll2Q8BGW8 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vgll2Q8BGW8 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vgll2Q8BGW8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vgll2Q8BGW8 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vgll2Q8BGW8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vgll2Q8BGW8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vgll2Q8BGW8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vgll2Q8BGW8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vgll2Q8BGW8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vgll2Q8BGW8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vgll2Q8BGW8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vgll2Q8BGW8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vgll2Q8BGW8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vgll2Q8BGW8 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vgll2Q8BGW8 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vgll2Q8BGW8 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vgll2Q8BGW8 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vgll2Q8BGW8 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vgll2Q8BGW8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vgll2Q8BGW8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vgll2Q8BGW8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vgll2Q8BGW8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vgll2Q8BGW8 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vgll2Q8BGW8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Vgll2Q8BGW8 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vgll2Q8BGW8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vgll2Q8BGW8 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vgll2Q8BGW8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vgll2Q8BGW8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vgll2Q8BGW8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vgll2Q8BGW8 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Vgll2Q8BGW8 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vgll2Q8BGW8 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vgll2Q8BGW8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vgll2Q8BGW8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vgll2Q8BGW8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vgll2Q8BGW8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vgll2Q8BGW8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vgll2Q8BGW8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vgll2Q8BGW8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vgll2Q8BGW8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vgll2Q8BGW8 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Vgll2Q8BGW8 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Vgll2Q8BGW8 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Vgll2Q8BGW8 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vgll2Q8BGW8 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vgll2Q8BGW8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vgll2Q8BGW8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Vgll2Q8BGW8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vgll2Q8BGW8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vgll2Q8BGW8 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vgll2Q8BGW8 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vgll2Q8BGW8 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vgll2Q8BGW8 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vgll2Q8BGW8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vgll2Q8BGW8 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vgll2Q8BGW8 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vgll2Q8BGW8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vgll2Q8BGW8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vgll2Q8BGW8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vgll2Q8BGW8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vgll2Q8BGW8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vgll2Q8BGW8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vgll2Q8BGW8 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vgll2Q8BGW8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vgll2Q8BGW8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vgll2Q8BGW8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vgll2Q8BGW8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vgll2Q8BGW8 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vgll2Q8BGW8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vgll2Q8BGW8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vgll2Q8BGW8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vgll2Q8BGW8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vgll2Q8BGW8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vgll2Q8BGW8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vgll2Q8BGW8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vgll2Q8BGW8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vgll2Q8BGW8 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vgll2Q8BGW8 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Vgll2Q8BGW8 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Vgll2Q8BGW8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vgll2Q8BGW8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vgll2Q8BGW8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms