Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGU0

Cyp4f39, Cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 39, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f39Q8BGU0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cyp4f39Q8BGU0 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Cyp4f39Q8BGU0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cyp4f39Q8BGU0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cyp4f39Q8BGU0 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cyp4f39Q8BGU0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cyp4f39Q8BGU0 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cyp4f39Q8BGU0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cyp4f39Q8BGU0 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cyp4f39Q8BGU0 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cyp4f39Q8BGU0 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cyp4f39Q8BGU0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cyp4f39Q8BGU0 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cyp4f39Q8BGU0 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cyp4f39Q8BGU0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cyp4f39Q8BGU0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cyp4f39Q8BGU0 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cyp4f39Q8BGU0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cyp4f39Q8BGU0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cyp4f39Q8BGU0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cyp4f39Q8BGU0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cyp4f39Q8BGU0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cyp4f39Q8BGU0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cyp4f39Q8BGU0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cyp4f39Q8BGU0 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cyp4f39Q8BGU0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cyp4f39Q8BGU0 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cyp4f39Q8BGU0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cyp4f39Q8BGU0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cyp4f39Q8BGU0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cyp4f39Q8BGU0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cyp4f39Q8BGU0 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cyp4f39Q8BGU0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cyp4f39Q8BGU0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cyp4f39Q8BGU0 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cyp4f39Q8BGU0 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cyp4f39Q8BGU0 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cyp4f39Q8BGU0 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Cyp4f39Q8BGU0 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cyp4f39Q8BGU0 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cyp4f39Q8BGU0 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cyp4f39Q8BGU0 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cyp4f39Q8BGU0 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cyp4f39Q8BGU0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cyp4f39Q8BGU0 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Cyp4f39Q8BGU0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cyp4f39Q8BGU0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cyp4f39Q8BGU0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cyp4f39Q8BGU0 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cyp4f39Q8BGU0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cyp4f39Q8BGU0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cyp4f39Q8BGU0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cyp4f39Q8BGU0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cyp4f39Q8BGU0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cyp4f39Q8BGU0 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cyp4f39Q8BGU0 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cyp4f39Q8BGU0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cyp4f39Q8BGU0 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cyp4f39Q8BGU0 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cyp4f39Q8BGU0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cyp4f39Q8BGU0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cyp4f39Q8BGU0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cyp4f39Q8BGU0 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Cyp4f39Q8BGU0 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cyp4f39Q8BGU0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cyp4f39Q8BGU0 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cyp4f39Q8BGU0 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cyp4f39Q8BGU0 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cyp4f39Q8BGU0 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cyp4f39Q8BGU0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cyp4f39Q8BGU0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cyp4f39Q8BGU0 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cyp4f39Q8BGU0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cyp4f39Q8BGU0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cyp4f39Q8BGU0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cyp4f39Q8BGU0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cyp4f39Q8BGU0 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cyp4f39Q8BGU0 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cyp4f39Q8BGU0 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Cyp4f39Q8BGU0 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cyp4f39Q8BGU0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cyp4f39Q8BGU0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cyp4f39Q8BGU0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cyp4f39Q8BGU0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cyp4f39Q8BGU0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cyp4f39Q8BGU0 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Cyp4f39Q8BGU0 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cyp4f39Q8BGU0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cyp4f39Q8BGU0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cyp4f39Q8BGU0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cyp4f39Q8BGU0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cyp4f39Q8BGU0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cyp4f39Q8BGU0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cyp4f39Q8BGU0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cyp4f39Q8BGU0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cyp4f39Q8BGU0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cyp4f39Q8BGU0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms