Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG54

Sptlc3, Serine palmitoyltransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptlc3Q8BG54 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sptlc3Q8BG54 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sptlc3Q8BG54 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sptlc3Q8BG54 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sptlc3Q8BG54 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sptlc3Q8BG54 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sptlc3Q8BG54 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sptlc3Q8BG54 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Sptlc3Q8BG54 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sptlc3Q8BG54 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sptlc3Q8BG54 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sptlc3Q8BG54 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sptlc3Q8BG54 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sptlc3Q8BG54 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sptlc3Q8BG54 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sptlc3Q8BG54 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sptlc3Q8BG54 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sptlc3Q8BG54 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sptlc3Q8BG54 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sptlc3Q8BG54 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sptlc3Q8BG54 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sptlc3Q8BG54 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sptlc3Q8BG54 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sptlc3Q8BG54 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sptlc3Q8BG54 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sptlc3Q8BG54 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sptlc3Q8BG54 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sptlc3Q8BG54 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sptlc3Q8BG54 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sptlc3Q8BG54 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sptlc3Q8BG54 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sptlc3Q8BG54 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sptlc3Q8BG54 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sptlc3Q8BG54 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sptlc3Q8BG54 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sptlc3Q8BG54 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sptlc3Q8BG54 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sptlc3Q8BG54 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sptlc3Q8BG54 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sptlc3Q8BG54 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sptlc3Q8BG54 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sptlc3Q8BG54 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sptlc3Q8BG54 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sptlc3Q8BG54 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sptlc3Q8BG54 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sptlc3Q8BG54 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sptlc3Q8BG54 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sptlc3Q8BG54 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sptlc3Q8BG54 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sptlc3Q8BG54 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sptlc3Q8BG54 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sptlc3Q8BG54 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sptlc3Q8BG54 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Sptlc3Q8BG54 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sptlc3Q8BG54 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sptlc3Q8BG54 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sptlc3Q8BG54 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sptlc3Q8BG54 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sptlc3Q8BG54 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sptlc3Q8BG54 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sptlc3Q8BG54 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sptlc3Q8BG54 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Sptlc3Q8BG54 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sptlc3Q8BG54 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sptlc3Q8BG54 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sptlc3Q8BG54 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sptlc3Q8BG54 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sptlc3Q8BG54 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sptlc3Q8BG54 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sptlc3Q8BG54 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sptlc3Q8BG54 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sptlc3Q8BG54 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sptlc3Q8BG54 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sptlc3Q8BG54 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sptlc3Q8BG54 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sptlc3Q8BG54 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sptlc3Q8BG54 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sptlc3Q8BG54 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sptlc3Q8BG54 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sptlc3Q8BG54 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sptlc3Q8BG54 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sptlc3Q8BG54 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sptlc3Q8BG54 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Sptlc3Q8BG54 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sptlc3Q8BG54 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Sptlc3Q8BG54 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Sptlc3Q8BG54 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sptlc3Q8BG54 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sptlc3Q8BG54 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sptlc3Q8BG54 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sptlc3Q8BG54 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sptlc3Q8BG54 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sptlc3Q8BG54 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sptlc3Q8BG54 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sptlc3Q8BG54 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sptlc3Q8BG54 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sptlc3Q8BG54 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sptlc3Q8BG54 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Sptlc3Q8BG54 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sptlc3Q8BG54 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms