Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW9

H2-M10.2, Histocompatibility 2, M region locus 10.2, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.2Q85ZW9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
H2-M10.2Q85ZW9 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
H2-M10.2Q85ZW9 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
H2-M10.2Q85ZW9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
H2-M10.2Q85ZW9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
H2-M10.2Q85ZW9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
H2-M10.2Q85ZW9 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
H2-M10.2Q85ZW9 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
H2-M10.2Q85ZW9 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
H2-M10.2Q85ZW9 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
H2-M10.2Q85ZW9 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
H2-M10.2Q85ZW9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
H2-M10.2Q85ZW9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2-M10.2Q85ZW9 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2-M10.2Q85ZW9 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2-M10.2Q85ZW9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2-M10.2Q85ZW9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2-M10.2Q85ZW9 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2-M10.2Q85ZW9 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2-M10.2Q85ZW9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2-M10.2Q85ZW9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2-M10.2Q85ZW9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2-M10.2Q85ZW9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2-M10.2Q85ZW9 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2-M10.2Q85ZW9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2-M10.2Q85ZW9 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2-M10.2Q85ZW9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2-M10.2Q85ZW9 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
H2-M10.2Q85ZW9 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2-M10.2Q85ZW9 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2-M10.2Q85ZW9 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2-M10.2Q85ZW9 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
H2-M10.2Q85ZW9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2-M10.2Q85ZW9 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2-M10.2Q85ZW9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2-M10.2Q85ZW9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2-M10.2Q85ZW9 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2-M10.2Q85ZW9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2-M10.2Q85ZW9 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2-M10.2Q85ZW9 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2-M10.2Q85ZW9 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2-M10.2Q85ZW9 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
H2-M10.2Q85ZW9 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2-M10.2Q85ZW9 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2-M10.2Q85ZW9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2-M10.2Q85ZW9 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2-M10.2Q85ZW9 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2-M10.2Q85ZW9 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2-M10.2Q85ZW9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2-M10.2Q85ZW9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2-M10.2Q85ZW9 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2-M10.2Q85ZW9 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2-M10.2Q85ZW9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2-M10.2Q85ZW9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2-M10.2Q85ZW9 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2-M10.2Q85ZW9 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2-M10.2Q85ZW9 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2-M10.2Q85ZW9 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2-M10.2Q85ZW9 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2-M10.2Q85ZW9 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2-M10.2Q85ZW9 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2-M10.2Q85ZW9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2-M10.2Q85ZW9 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
H2-M10.2Q85ZW9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
H2-M10.2Q85ZW9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2-M10.2Q85ZW9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2-M10.2Q85ZW9 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2-M10.2Q85ZW9 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2-M10.2Q85ZW9 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2-M10.2Q85ZW9 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2-M10.2Q85ZW9 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2-M10.2Q85ZW9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2-M10.2Q85ZW9 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2-M10.2Q85ZW9 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2-M10.2Q85ZW9 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2-M10.2Q85ZW9 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2-M10.2Q85ZW9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2-M10.2Q85ZW9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2-M10.2Q85ZW9 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2-M10.2Q85ZW9 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2-M10.2Q85ZW9 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2-M10.2Q85ZW9 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2-M10.2Q85ZW9 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2-M10.2Q85ZW9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2-M10.2Q85ZW9 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2-M10.2Q85ZW9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2-M10.2Q85ZW9 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
H2-M10.2Q85ZW9 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
H2-M10.2Q85ZW9 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
H2-M10.2Q85ZW9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
H2-M10.2Q85ZW9 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
H2-M10.2Q85ZW9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
H2-M10.2Q85ZW9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2-M10.2Q85ZW9 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2-M10.2Q85ZW9 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
H2-M10.2Q85ZW9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2-M10.2Q85ZW9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2-M10.2Q85ZW9 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
H2-M10.2Q85ZW9 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H2-M10.2Q85ZW9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms