Protein–RNA interactions for Protein: Q811B5

Prr3, Proline-rich protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr3Q811B5 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Prr3Q811B5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prr3Q811B5 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prr3Q811B5 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prr3Q811B5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prr3Q811B5 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prr3Q811B5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prr3Q811B5 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prr3Q811B5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prr3Q811B5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prr3Q811B5 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prr3Q811B5 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prr3Q811B5 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prr3Q811B5 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prr3Q811B5 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prr3Q811B5 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prr3Q811B5 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prr3Q811B5 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prr3Q811B5 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prr3Q811B5 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prr3Q811B5 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prr3Q811B5 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prr3Q811B5 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prr3Q811B5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Prr3Q811B5 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prr3Q811B5 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prr3Q811B5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prr3Q811B5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prr3Q811B5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prr3Q811B5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prr3Q811B5 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prr3Q811B5 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prr3Q811B5 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prr3Q811B5 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prr3Q811B5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prr3Q811B5 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prr3Q811B5 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prr3Q811B5 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prr3Q811B5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prr3Q811B5 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prr3Q811B5 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prr3Q811B5 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prr3Q811B5 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prr3Q811B5 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prr3Q811B5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Prr3Q811B5 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prr3Q811B5 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prr3Q811B5 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prr3Q811B5 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prr3Q811B5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Prr3Q811B5 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prr3Q811B5 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prr3Q811B5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prr3Q811B5 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prr3Q811B5 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prr3Q811B5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prr3Q811B5 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prr3Q811B5 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prr3Q811B5 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prr3Q811B5 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr3Q811B5 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr3Q811B5 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr3Q811B5 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr3Q811B5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr3Q811B5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr3Q811B5 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr3Q811B5 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr3Q811B5 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr3Q811B5 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr3Q811B5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr3Q811B5 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr3Q811B5 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr3Q811B5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr3Q811B5 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr3Q811B5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr3Q811B5 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr3Q811B5 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr3Q811B5 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr3Q811B5 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr3Q811B5 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr3Q811B5 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr3Q811B5 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr3Q811B5 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr3Q811B5 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr3Q811B5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr3Q811B5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr3Q811B5 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr3Q811B5 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr3Q811B5 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr3Q811B5 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr3Q811B5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr3Q811B5 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prr3Q811B5 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prr3Q811B5 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prr3Q811B5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prr3Q811B5 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prr3Q811B5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Prr3Q811B5 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prr3Q811B5 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Prr3Q811B5 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms