Protein–RNA interactions for Protein: Q810U3

Nfasc, Neurofascin, mousemouse

Predictions only

Length 1,240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfascQ810U3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NfascQ810U3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NfascQ810U3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NfascQ810U3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NfascQ810U3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NfascQ810U3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NfascQ810U3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NfascQ810U3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NfascQ810U3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NfascQ810U3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NfascQ810U3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NfascQ810U3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NfascQ810U3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NfascQ810U3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NfascQ810U3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NfascQ810U3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NfascQ810U3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NfascQ810U3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NfascQ810U3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NfascQ810U3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NfascQ810U3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NfascQ810U3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NfascQ810U3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NfascQ810U3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NfascQ810U3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NfascQ810U3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NfascQ810U3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NfascQ810U3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NfascQ810U3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NfascQ810U3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NfascQ810U3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NfascQ810U3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NfascQ810U3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NfascQ810U3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NfascQ810U3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NfascQ810U3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NfascQ810U3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NfascQ810U3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NfascQ810U3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NfascQ810U3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NfascQ810U3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NfascQ810U3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NfascQ810U3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NfascQ810U3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NfascQ810U3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NfascQ810U3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NfascQ810U3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NfascQ810U3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NfascQ810U3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NfascQ810U3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NfascQ810U3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NfascQ810U3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NfascQ810U3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NfascQ810U3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NfascQ810U3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NfascQ810U3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NfascQ810U3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NfascQ810U3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NfascQ810U3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NfascQ810U3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NfascQ810U3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NfascQ810U3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NfascQ810U3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NfascQ810U3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NfascQ810U3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NfascQ810U3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NfascQ810U3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NfascQ810U3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NfascQ810U3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NfascQ810U3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NfascQ810U3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NfascQ810U3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NfascQ810U3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NfascQ810U3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NfascQ810U3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NfascQ810U3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NfascQ810U3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NfascQ810U3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NfascQ810U3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NfascQ810U3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NfascQ810U3 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NfascQ810U3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NfascQ810U3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NfascQ810U3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NfascQ810U3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NfascQ810U3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NfascQ810U3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NfascQ810U3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
NfascQ810U3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NfascQ810U3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NfascQ810U3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NfascQ810U3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NfascQ810U3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NfascQ810U3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NfascQ810U3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NfascQ810U3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NfascQ810U3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NfascQ810U3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NfascQ810U3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NfascQ810U3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms