Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smim19Q80ZU4 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smim19Q80ZU4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim19Q80ZU4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim19Q80ZU4 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim19Q80ZU4 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim19Q80ZU4 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim19Q80ZU4 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim19Q80ZU4 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim19Q80ZU4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim19Q80ZU4 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim19Q80ZU4 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim19Q80ZU4 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim19Q80ZU4 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim19Q80ZU4 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim19Q80ZU4 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim19Q80ZU4 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim19Q80ZU4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim19Q80ZU4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim19Q80ZU4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim19Q80ZU4 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim19Q80ZU4 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim19Q80ZU4 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim19Q80ZU4 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim19Q80ZU4 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim19Q80ZU4 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim19Q80ZU4 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim19Q80ZU4 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim19Q80ZU4 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim19Q80ZU4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim19Q80ZU4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim19Q80ZU4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim19Q80ZU4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim19Q80ZU4 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim19Q80ZU4 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim19Q80ZU4 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim19Q80ZU4 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim19Q80ZU4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim19Q80ZU4 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim19Q80ZU4 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim19Q80ZU4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim19Q80ZU4 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim19Q80ZU4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim19Q80ZU4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim19Q80ZU4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim19Q80ZU4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim19Q80ZU4 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim19Q80ZU4 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim19Q80ZU4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim19Q80ZU4 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim19Q80ZU4 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smim19Q80ZU4 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smim19Q80ZU4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smim19Q80ZU4 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smim19Q80ZU4 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smim19Q80ZU4 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smim19Q80ZU4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smim19Q80ZU4 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smim19Q80ZU4 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smim19Q80ZU4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smim19Q80ZU4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smim19Q80ZU4 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smim19Q80ZU4 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smim19Q80ZU4 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Smim19Q80ZU4 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Smim19Q80ZU4 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Smim19Q80ZU4 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smim19Q80ZU4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smim19Q80ZU4 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smim19Q80ZU4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smim19Q80ZU4 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smim19Q80ZU4 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smim19Q80ZU4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smim19Q80ZU4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smim19Q80ZU4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smim19Q80ZU4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smim19Q80ZU4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smim19Q80ZU4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smim19Q80ZU4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smim19Q80ZU4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Smim19Q80ZU4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smim19Q80ZU4 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smim19Q80ZU4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smim19Q80ZU4 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smim19Q80ZU4 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smim19Q80ZU4 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smim19Q80ZU4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smim19Q80ZU4 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smim19Q80ZU4 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smim19Q80ZU4 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smim19Q80ZU4 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smim19Q80ZU4 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smim19Q80ZU4 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smim19Q80ZU4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smim19Q80ZU4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smim19Q80ZU4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smim19Q80ZU4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smim19Q80ZU4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smim19Q80ZU4 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smim19Q80ZU4 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms