Protein–RNA interactions for Protein: Q80WR1

Tspan18, Tetraspanin-18, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan18Q80WR1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
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Tspan18Q80WR1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tspan18Q80WR1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tspan18Q80WR1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tspan18Q80WR1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tspan18Q80WR1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tspan18Q80WR1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
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Tspan18Q80WR1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
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Tspan18Q80WR1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
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Tspan18Q80WR1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms