Protein–RNA interactions for Protein: Q80UK0

Sestd1, SEC14 domain and spectrin repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sestd1Q80UK0 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sestd1Q80UK0 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Sestd1Q80UK0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sestd1Q80UK0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sestd1Q80UK0 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Sestd1Q80UK0 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Sestd1Q80UK0 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Sestd1Q80UK0 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Sestd1Q80UK0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sestd1Q80UK0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sestd1Q80UK0 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sestd1Q80UK0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sestd1Q80UK0 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sestd1Q80UK0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Sestd1Q80UK0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sestd1Q80UK0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sestd1Q80UK0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sestd1Q80UK0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sestd1Q80UK0 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sestd1Q80UK0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sestd1Q80UK0 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sestd1Q80UK0 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sestd1Q80UK0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sestd1Q80UK0 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sestd1Q80UK0 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sestd1Q80UK0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sestd1Q80UK0 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sestd1Q80UK0 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sestd1Q80UK0 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sestd1Q80UK0 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sestd1Q80UK0 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sestd1Q80UK0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sestd1Q80UK0 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sestd1Q80UK0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sestd1Q80UK0 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sestd1Q80UK0 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sestd1Q80UK0 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sestd1Q80UK0 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sestd1Q80UK0 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sestd1Q80UK0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sestd1Q80UK0 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sestd1Q80UK0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sestd1Q80UK0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sestd1Q80UK0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sestd1Q80UK0 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Sestd1Q80UK0 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sestd1Q80UK0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sestd1Q80UK0 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Sestd1Q80UK0 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Sestd1Q80UK0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sestd1Q80UK0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sestd1Q80UK0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sestd1Q80UK0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sestd1Q80UK0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sestd1Q80UK0 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sestd1Q80UK0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sestd1Q80UK0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sestd1Q80UK0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sestd1Q80UK0 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sestd1Q80UK0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Sestd1Q80UK0 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sestd1Q80UK0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sestd1Q80UK0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sestd1Q80UK0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sestd1Q80UK0 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sestd1Q80UK0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sestd1Q80UK0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sestd1Q80UK0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sestd1Q80UK0 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sestd1Q80UK0 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Sestd1Q80UK0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sestd1Q80UK0 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sestd1Q80UK0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sestd1Q80UK0 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sestd1Q80UK0 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sestd1Q80UK0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sestd1Q80UK0 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sestd1Q80UK0 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sestd1Q80UK0 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sestd1Q80UK0 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sestd1Q80UK0 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sestd1Q80UK0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sestd1Q80UK0 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sestd1Q80UK0 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sestd1Q80UK0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sestd1Q80UK0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sestd1Q80UK0 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sestd1Q80UK0 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Sestd1Q80UK0 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sestd1Q80UK0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sestd1Q80UK0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Sestd1Q80UK0 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sestd1Q80UK0 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sestd1Q80UK0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sestd1Q80UK0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sestd1Q80UK0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sestd1Q80UK0 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sestd1Q80UK0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sestd1Q80UK0 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Sestd1Q80UK0 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms