Protein–RNA interactions for Protein: Q80UF9

Otop3, Otopetrin-3, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otop3Q80UF9 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Otop3Q80UF9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Otop3Q80UF9 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Otop3Q80UF9 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Otop3Q80UF9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Otop3Q80UF9 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Otop3Q80UF9 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Otop3Q80UF9 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Otop3Q80UF9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Otop3Q80UF9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Otop3Q80UF9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Otop3Q80UF9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Otop3Q80UF9 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Otop3Q80UF9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Otop3Q80UF9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Otop3Q80UF9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Otop3Q80UF9 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Otop3Q80UF9 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Otop3Q80UF9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Otop3Q80UF9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Otop3Q80UF9 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Otop3Q80UF9 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Otop3Q80UF9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Otop3Q80UF9 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Otop3Q80UF9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Otop3Q80UF9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Otop3Q80UF9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Otop3Q80UF9 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Otop3Q80UF9 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Otop3Q80UF9 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Otop3Q80UF9 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Otop3Q80UF9 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Otop3Q80UF9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Otop3Q80UF9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Otop3Q80UF9 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Otop3Q80UF9 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Otop3Q80UF9 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Otop3Q80UF9 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Otop3Q80UF9 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Otop3Q80UF9 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Otop3Q80UF9 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Otop3Q80UF9 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Otop3Q80UF9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Otop3Q80UF9 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Otop3Q80UF9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Otop3Q80UF9 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Otop3Q80UF9 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Otop3Q80UF9 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Otop3Q80UF9 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Otop3Q80UF9 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Otop3Q80UF9 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Otop3Q80UF9 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Otop3Q80UF9 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Otop3Q80UF9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Otop3Q80UF9 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Otop3Q80UF9 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Otop3Q80UF9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Otop3Q80UF9 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Otop3Q80UF9 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Otop3Q80UF9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Otop3Q80UF9 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Otop3Q80UF9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Otop3Q80UF9 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Otop3Q80UF9 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Otop3Q80UF9 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Otop3Q80UF9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Otop3Q80UF9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Otop3Q80UF9 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Otop3Q80UF9 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Otop3Q80UF9 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Otop3Q80UF9 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Otop3Q80UF9 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Otop3Q80UF9 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Otop3Q80UF9 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Otop3Q80UF9 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Otop3Q80UF9 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Otop3Q80UF9 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Otop3Q80UF9 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Otop3Q80UF9 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Otop3Q80UF9 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Otop3Q80UF9 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Otop3Q80UF9 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Otop3Q80UF9 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Otop3Q80UF9 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Otop3Q80UF9 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Otop3Q80UF9 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Otop3Q80UF9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Otop3Q80UF9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Otop3Q80UF9 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Otop3Q80UF9 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Otop3Q80UF9 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Otop3Q80UF9 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Otop3Q80UF9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Otop3Q80UF9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Otop3Q80UF9 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Otop3Q80UF9 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Otop3Q80UF9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Otop3Q80UF9 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Otop3Q80UF9 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Otop3Q80UF9 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms