Protein–RNA interactions for Protein: Q80U95

Ube3c, Ubiquitin-protein ligase E3C, mousemouse

Predictions only

Length 1,083 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3cQ80U95 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ube3cQ80U95 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ube3cQ80U95 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ube3cQ80U95 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ube3cQ80U95 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ube3cQ80U95 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ube3cQ80U95 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ube3cQ80U95 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ube3cQ80U95 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ube3cQ80U95 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ube3cQ80U95 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ube3cQ80U95 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ube3cQ80U95 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ube3cQ80U95 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ube3cQ80U95 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ube3cQ80U95 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ube3cQ80U95 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ube3cQ80U95 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ube3cQ80U95 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ube3cQ80U95 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ube3cQ80U95 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ube3cQ80U95 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ube3cQ80U95 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ube3cQ80U95 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ube3cQ80U95 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ube3cQ80U95 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ube3cQ80U95 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ube3cQ80U95 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ube3cQ80U95 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ube3cQ80U95 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ube3cQ80U95 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ube3cQ80U95 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ube3cQ80U95 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ube3cQ80U95 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ube3cQ80U95 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ube3cQ80U95 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ube3cQ80U95 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ube3cQ80U95 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ube3cQ80U95 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ube3cQ80U95 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ube3cQ80U95 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ube3cQ80U95 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ube3cQ80U95 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ube3cQ80U95 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ube3cQ80U95 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ube3cQ80U95 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ube3cQ80U95 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ube3cQ80U95 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ube3cQ80U95 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ube3cQ80U95 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ube3cQ80U95 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ube3cQ80U95 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ube3cQ80U95 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ube3cQ80U95 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ube3cQ80U95 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ube3cQ80U95 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Ube3cQ80U95 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ube3cQ80U95 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ube3cQ80U95 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Ube3cQ80U95 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ube3cQ80U95 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ube3cQ80U95 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ube3cQ80U95 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ube3cQ80U95 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ube3cQ80U95 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ube3cQ80U95 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ube3cQ80U95 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ube3cQ80U95 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ube3cQ80U95 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ube3cQ80U95 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ube3cQ80U95 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ube3cQ80U95 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ube3cQ80U95 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ube3cQ80U95 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ube3cQ80U95 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ube3cQ80U95 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ube3cQ80U95 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ube3cQ80U95 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Ube3cQ80U95 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ube3cQ80U95 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ube3cQ80U95 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ube3cQ80U95 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ube3cQ80U95 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ube3cQ80U95 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Ube3cQ80U95 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ube3cQ80U95 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ube3cQ80U95 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ube3cQ80U95 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ube3cQ80U95 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ube3cQ80U95 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ube3cQ80U95 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ube3cQ80U95 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ube3cQ80U95 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ube3cQ80U95 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ube3cQ80U95 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ube3cQ80U95 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ube3cQ80U95 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ube3cQ80U95 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ube3cQ80U95 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ube3cQ80U95 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms