Protein–RNA interactions for Protein: Q80U49

Cep170b, Centrosomal protein of 170 kDa protein B, mousemouse

Predictions only

Length 1,574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep170bQ80U49 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cep170bQ80U49 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Cep170bQ80U49 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Cep170bQ80U49 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cep170bQ80U49 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cep170bQ80U49 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cep170bQ80U49 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cep170bQ80U49 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cep170bQ80U49 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cep170bQ80U49 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Cep170bQ80U49 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cep170bQ80U49 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cep170bQ80U49 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cep170bQ80U49 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cep170bQ80U49 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Cep170bQ80U49 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cep170bQ80U49 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cep170bQ80U49 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cep170bQ80U49 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Cep170bQ80U49 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cep170bQ80U49 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Cep170bQ80U49 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cep170bQ80U49 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cep170bQ80U49 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cep170bQ80U49 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cep170bQ80U49 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cep170bQ80U49 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Cep170bQ80U49 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Cep170bQ80U49 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Cep170bQ80U49 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cep170bQ80U49 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Cep170bQ80U49 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Cep170bQ80U49 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cep170bQ80U49 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cep170bQ80U49 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cep170bQ80U49 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cep170bQ80U49 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Cep170bQ80U49 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Cep170bQ80U49 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cep170bQ80U49 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cep170bQ80U49 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cep170bQ80U49 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cep170bQ80U49 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cep170bQ80U49 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Cep170bQ80U49 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cep170bQ80U49 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Cep170bQ80U49 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Cep170bQ80U49 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Cep170bQ80U49 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Cep170bQ80U49 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cep170bQ80U49 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cep170bQ80U49 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Cep170bQ80U49 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Cep170bQ80U49 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cep170bQ80U49 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cep170bQ80U49 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Cep170bQ80U49 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cep170bQ80U49 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cep170bQ80U49 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC27.51■■■□□ 2
Cep170bQ80U49 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cep170bQ80U49 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cep170bQ80U49 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cep170bQ80U49 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cep170bQ80U49 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cep170bQ80U49 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cep170bQ80U49 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cep170bQ80U49 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cep170bQ80U49 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cep170bQ80U49 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cep170bQ80U49 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cep170bQ80U49 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cep170bQ80U49 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cep170bQ80U49 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cep170bQ80U49 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cep170bQ80U49 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cep170bQ80U49 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cep170bQ80U49 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cep170bQ80U49 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cep170bQ80U49 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cep170bQ80U49 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cep170bQ80U49 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cep170bQ80U49 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cep170bQ80U49 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cep170bQ80U49 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Cep170bQ80U49 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cep170bQ80U49 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cep170bQ80U49 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cep170bQ80U49 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cep170bQ80U49 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cep170bQ80U49 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cep170bQ80U49 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cep170bQ80U49 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cep170bQ80U49 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cep170bQ80U49 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cep170bQ80U49 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cep170bQ80U49 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Cep170bQ80U49 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cep170bQ80U49 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cep170bQ80U49 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cep170bQ80U49 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms