Protein–RNA interactions for Protein: Q7TST5

Lamp3, Lysosome-associated membrane glycoprotein 3, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp3Q7TST5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lamp3Q7TST5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lamp3Q7TST5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lamp3Q7TST5 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lamp3Q7TST5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lamp3Q7TST5 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lamp3Q7TST5 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lamp3Q7TST5 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lamp3Q7TST5 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lamp3Q7TST5 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lamp3Q7TST5 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lamp3Q7TST5 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lamp3Q7TST5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lamp3Q7TST5 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lamp3Q7TST5 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lamp3Q7TST5 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lamp3Q7TST5 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lamp3Q7TST5 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lamp3Q7TST5 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lamp3Q7TST5 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lamp3Q7TST5 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lamp3Q7TST5 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lamp3Q7TST5 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lamp3Q7TST5 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lamp3Q7TST5 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lamp3Q7TST5 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lamp3Q7TST5 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lamp3Q7TST5 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Lamp3Q7TST5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lamp3Q7TST5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lamp3Q7TST5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lamp3Q7TST5 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lamp3Q7TST5 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lamp3Q7TST5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lamp3Q7TST5 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lamp3Q7TST5 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lamp3Q7TST5 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lamp3Q7TST5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lamp3Q7TST5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lamp3Q7TST5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Lamp3Q7TST5 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lamp3Q7TST5 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lamp3Q7TST5 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lamp3Q7TST5 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lamp3Q7TST5 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lamp3Q7TST5 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Lamp3Q7TST5 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lamp3Q7TST5 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lamp3Q7TST5 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lamp3Q7TST5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lamp3Q7TST5 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lamp3Q7TST5 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lamp3Q7TST5 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lamp3Q7TST5 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lamp3Q7TST5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lamp3Q7TST5 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lamp3Q7TST5 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lamp3Q7TST5 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lamp3Q7TST5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lamp3Q7TST5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lamp3Q7TST5 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lamp3Q7TST5 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lamp3Q7TST5 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lamp3Q7TST5 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lamp3Q7TST5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lamp3Q7TST5 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lamp3Q7TST5 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lamp3Q7TST5 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lamp3Q7TST5 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lamp3Q7TST5 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lamp3Q7TST5 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lamp3Q7TST5 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lamp3Q7TST5 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lamp3Q7TST5 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lamp3Q7TST5 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lamp3Q7TST5 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lamp3Q7TST5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lamp3Q7TST5 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lamp3Q7TST5 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lamp3Q7TST5 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lamp3Q7TST5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lamp3Q7TST5 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lamp3Q7TST5 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lamp3Q7TST5 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lamp3Q7TST5 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lamp3Q7TST5 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lamp3Q7TST5 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lamp3Q7TST5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lamp3Q7TST5 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lamp3Q7TST5 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Lamp3Q7TST5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lamp3Q7TST5 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lamp3Q7TST5 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lamp3Q7TST5 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lamp3Q7TST5 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lamp3Q7TST5 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lamp3Q7TST5 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lamp3Q7TST5 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lamp3Q7TST5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lamp3Q7TST5 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms