Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSI0

Znf12, Zinc finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 686 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf12Q7TSI0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Znf12Q7TSI0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Znf12Q7TSI0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Znf12Q7TSI0 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Znf12Q7TSI0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Znf12Q7TSI0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Znf12Q7TSI0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Znf12Q7TSI0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Znf12Q7TSI0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Znf12Q7TSI0 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Znf12Q7TSI0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Znf12Q7TSI0 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Znf12Q7TSI0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Znf12Q7TSI0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Znf12Q7TSI0 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Znf12Q7TSI0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Znf12Q7TSI0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Znf12Q7TSI0 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Znf12Q7TSI0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Znf12Q7TSI0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Znf12Q7TSI0 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Znf12Q7TSI0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Znf12Q7TSI0 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Znf12Q7TSI0 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Znf12Q7TSI0 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Znf12Q7TSI0 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Znf12Q7TSI0 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Znf12Q7TSI0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Znf12Q7TSI0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Znf12Q7TSI0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Znf12Q7TSI0 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Znf12Q7TSI0 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Znf12Q7TSI0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Znf12Q7TSI0 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Znf12Q7TSI0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Znf12Q7TSI0 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Znf12Q7TSI0 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Znf12Q7TSI0 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Znf12Q7TSI0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Znf12Q7TSI0 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Znf12Q7TSI0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Znf12Q7TSI0 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Znf12Q7TSI0 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Znf12Q7TSI0 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Znf12Q7TSI0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Znf12Q7TSI0 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Znf12Q7TSI0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Znf12Q7TSI0 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Znf12Q7TSI0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Znf12Q7TSI0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Znf12Q7TSI0 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Znf12Q7TSI0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Znf12Q7TSI0 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Znf12Q7TSI0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Znf12Q7TSI0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Znf12Q7TSI0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Znf12Q7TSI0 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Znf12Q7TSI0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Znf12Q7TSI0 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Znf12Q7TSI0 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Znf12Q7TSI0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Znf12Q7TSI0 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Znf12Q7TSI0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Znf12Q7TSI0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Znf12Q7TSI0 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Znf12Q7TSI0 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Znf12Q7TSI0 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Znf12Q7TSI0 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Znf12Q7TSI0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Znf12Q7TSI0 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Znf12Q7TSI0 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Znf12Q7TSI0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Znf12Q7TSI0 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Znf12Q7TSI0 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Znf12Q7TSI0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Znf12Q7TSI0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Znf12Q7TSI0 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Znf12Q7TSI0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Znf12Q7TSI0 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Znf12Q7TSI0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Znf12Q7TSI0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Znf12Q7TSI0 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Znf12Q7TSI0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Znf12Q7TSI0 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Znf12Q7TSI0 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Znf12Q7TSI0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Znf12Q7TSI0 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Znf12Q7TSI0 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Znf12Q7TSI0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Znf12Q7TSI0 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Znf12Q7TSI0 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Znf12Q7TSI0 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Znf12Q7TSI0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Znf12Q7TSI0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Znf12Q7TSI0 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Znf12Q7TSI0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Znf12Q7TSI0 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Znf12Q7TSI0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Znf12Q7TSI0 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Znf12Q7TSI0 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms