Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH2

Phkb, Phosphorylase b kinase regulatory subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,085 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PhkbQ7TSH2 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PhkbQ7TSH2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PhkbQ7TSH2 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PhkbQ7TSH2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PhkbQ7TSH2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PhkbQ7TSH2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PhkbQ7TSH2 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PhkbQ7TSH2 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PhkbQ7TSH2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PhkbQ7TSH2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PhkbQ7TSH2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PhkbQ7TSH2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PhkbQ7TSH2 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PhkbQ7TSH2 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PhkbQ7TSH2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PhkbQ7TSH2 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PhkbQ7TSH2 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PhkbQ7TSH2 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PhkbQ7TSH2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PhkbQ7TSH2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PhkbQ7TSH2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PhkbQ7TSH2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PhkbQ7TSH2 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PhkbQ7TSH2 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PhkbQ7TSH2 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PhkbQ7TSH2 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PhkbQ7TSH2 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PhkbQ7TSH2 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PhkbQ7TSH2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PhkbQ7TSH2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PhkbQ7TSH2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PhkbQ7TSH2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PhkbQ7TSH2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PhkbQ7TSH2 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PhkbQ7TSH2 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PhkbQ7TSH2 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PhkbQ7TSH2 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PhkbQ7TSH2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PhkbQ7TSH2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PhkbQ7TSH2 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PhkbQ7TSH2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PhkbQ7TSH2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PhkbQ7TSH2 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PhkbQ7TSH2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PhkbQ7TSH2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PhkbQ7TSH2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PhkbQ7TSH2 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PhkbQ7TSH2 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PhkbQ7TSH2 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PhkbQ7TSH2 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PhkbQ7TSH2 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PhkbQ7TSH2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PhkbQ7TSH2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PhkbQ7TSH2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PhkbQ7TSH2 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PhkbQ7TSH2 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PhkbQ7TSH2 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PhkbQ7TSH2 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PhkbQ7TSH2 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PhkbQ7TSH2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PhkbQ7TSH2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PhkbQ7TSH2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PhkbQ7TSH2 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PhkbQ7TSH2 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PhkbQ7TSH2 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PhkbQ7TSH2 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PhkbQ7TSH2 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PhkbQ7TSH2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PhkbQ7TSH2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PhkbQ7TSH2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PhkbQ7TSH2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PhkbQ7TSH2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PhkbQ7TSH2 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PhkbQ7TSH2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PhkbQ7TSH2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PhkbQ7TSH2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PhkbQ7TSH2 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PhkbQ7TSH2 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PhkbQ7TSH2 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PhkbQ7TSH2 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PhkbQ7TSH2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PhkbQ7TSH2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PhkbQ7TSH2 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PhkbQ7TSH2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PhkbQ7TSH2 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PhkbQ7TSH2 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PhkbQ7TSH2 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PhkbQ7TSH2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PhkbQ7TSH2 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PhkbQ7TSH2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PhkbQ7TSH2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PhkbQ7TSH2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PhkbQ7TSH2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PhkbQ7TSH2 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PhkbQ7TSH2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PhkbQ7TSH2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PhkbQ7TSH2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PhkbQ7TSH2 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PhkbQ7TSH2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PhkbQ7TSH2 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms