Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSG2

Ctdp1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdp1Q7TSG2 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctdp1Q7TSG2 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctdp1Q7TSG2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctdp1Q7TSG2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctdp1Q7TSG2 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctdp1Q7TSG2 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctdp1Q7TSG2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctdp1Q7TSG2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctdp1Q7TSG2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctdp1Q7TSG2 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctdp1Q7TSG2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctdp1Q7TSG2 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctdp1Q7TSG2 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctdp1Q7TSG2 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ctdp1Q7TSG2 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ctdp1Q7TSG2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ctdp1Q7TSG2 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ctdp1Q7TSG2 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ctdp1Q7TSG2 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ctdp1Q7TSG2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ctdp1Q7TSG2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ctdp1Q7TSG2 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ctdp1Q7TSG2 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctdp1Q7TSG2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctdp1Q7TSG2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctdp1Q7TSG2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctdp1Q7TSG2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctdp1Q7TSG2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctdp1Q7TSG2 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctdp1Q7TSG2 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctdp1Q7TSG2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctdp1Q7TSG2 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctdp1Q7TSG2 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctdp1Q7TSG2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ctdp1Q7TSG2 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ctdp1Q7TSG2 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ctdp1Q7TSG2 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ctdp1Q7TSG2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Ctdp1Q7TSG2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ctdp1Q7TSG2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ctdp1Q7TSG2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ctdp1Q7TSG2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ctdp1Q7TSG2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ctdp1Q7TSG2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ctdp1Q7TSG2 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ctdp1Q7TSG2 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ctdp1Q7TSG2 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ctdp1Q7TSG2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Ctdp1Q7TSG2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Ctdp1Q7TSG2 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ctdp1Q7TSG2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ctdp1Q7TSG2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ctdp1Q7TSG2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ctdp1Q7TSG2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ctdp1Q7TSG2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ctdp1Q7TSG2 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ctdp1Q7TSG2 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ctdp1Q7TSG2 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ctdp1Q7TSG2 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ctdp1Q7TSG2 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ctdp1Q7TSG2 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ctdp1Q7TSG2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ctdp1Q7TSG2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ctdp1Q7TSG2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ctdp1Q7TSG2 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ctdp1Q7TSG2 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ctdp1Q7TSG2 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ctdp1Q7TSG2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ctdp1Q7TSG2 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ctdp1Q7TSG2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ctdp1Q7TSG2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ctdp1Q7TSG2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ctdp1Q7TSG2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ctdp1Q7TSG2 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ctdp1Q7TSG2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ctdp1Q7TSG2 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ctdp1Q7TSG2 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ctdp1Q7TSG2 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ctdp1Q7TSG2 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ctdp1Q7TSG2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ctdp1Q7TSG2 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ctdp1Q7TSG2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ctdp1Q7TSG2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ctdp1Q7TSG2 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ctdp1Q7TSG2 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ctdp1Q7TSG2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ctdp1Q7TSG2 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ctdp1Q7TSG2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ctdp1Q7TSG2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ctdp1Q7TSG2 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ctdp1Q7TSG2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ctdp1Q7TSG2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ctdp1Q7TSG2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ctdp1Q7TSG2 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ctdp1Q7TSG2 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ctdp1Q7TSG2 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ctdp1Q7TSG2 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ctdp1Q7TSG2 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ctdp1Q7TSG2 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ctdp1Q7TSG2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms