Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dsg1cQ7TSF0 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dsg1cQ7TSF0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dsg1cQ7TSF0 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dsg1cQ7TSF0 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dsg1cQ7TSF0 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dsg1cQ7TSF0 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dsg1cQ7TSF0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dsg1cQ7TSF0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dsg1cQ7TSF0 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dsg1cQ7TSF0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dsg1cQ7TSF0 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dsg1cQ7TSF0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dsg1cQ7TSF0 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dsg1cQ7TSF0 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dsg1cQ7TSF0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Dsg1cQ7TSF0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Dsg1cQ7TSF0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dsg1cQ7TSF0 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dsg1cQ7TSF0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dsg1cQ7TSF0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dsg1cQ7TSF0 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dsg1cQ7TSF0 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dsg1cQ7TSF0 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dsg1cQ7TSF0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dsg1cQ7TSF0 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dsg1cQ7TSF0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dsg1cQ7TSF0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dsg1cQ7TSF0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dsg1cQ7TSF0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dsg1cQ7TSF0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dsg1cQ7TSF0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dsg1cQ7TSF0 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dsg1cQ7TSF0 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dsg1cQ7TSF0 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Dsg1cQ7TSF0 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Dsg1cQ7TSF0 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dsg1cQ7TSF0 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dsg1cQ7TSF0 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dsg1cQ7TSF0 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dsg1cQ7TSF0 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Dsg1cQ7TSF0 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dsg1cQ7TSF0 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dsg1cQ7TSF0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dsg1cQ7TSF0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dsg1cQ7TSF0 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dsg1cQ7TSF0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dsg1cQ7TSF0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dsg1cQ7TSF0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dsg1cQ7TSF0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dsg1cQ7TSF0 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dsg1cQ7TSF0 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dsg1cQ7TSF0 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dsg1cQ7TSF0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dsg1cQ7TSF0 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dsg1cQ7TSF0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dsg1cQ7TSF0 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dsg1cQ7TSF0 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dsg1cQ7TSF0 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dsg1cQ7TSF0 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dsg1cQ7TSF0 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dsg1cQ7TSF0 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dsg1cQ7TSF0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dsg1cQ7TSF0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dsg1cQ7TSF0 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dsg1cQ7TSF0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dsg1cQ7TSF0 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dsg1cQ7TSF0 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dsg1cQ7TSF0 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dsg1cQ7TSF0 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dsg1cQ7TSF0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dsg1cQ7TSF0 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dsg1cQ7TSF0 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dsg1cQ7TSF0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dsg1cQ7TSF0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dsg1cQ7TSF0 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dsg1cQ7TSF0 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dsg1cQ7TSF0 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dsg1cQ7TSF0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dsg1cQ7TSF0 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dsg1cQ7TSF0 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dsg1cQ7TSF0 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dsg1cQ7TSF0 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dsg1cQ7TSF0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dsg1cQ7TSF0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dsg1cQ7TSF0 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dsg1cQ7TSF0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dsg1cQ7TSF0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dsg1cQ7TSF0 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dsg1cQ7TSF0 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dsg1cQ7TSF0 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dsg1cQ7TSF0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dsg1cQ7TSF0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dsg1cQ7TSF0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dsg1cQ7TSF0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dsg1cQ7TSF0 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Dsg1cQ7TSF0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dsg1cQ7TSF0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dsg1cQ7TSF0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dsg1cQ7TSF0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms