Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Prrc2bQ7TPM1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Prrc2bQ7TPM1 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Prrc2bQ7TPM1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Prrc2bQ7TPM1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Prrc2bQ7TPM1 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Prrc2bQ7TPM1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Prrc2bQ7TPM1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Prrc2bQ7TPM1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Prrc2bQ7TPM1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Prrc2bQ7TPM1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Prrc2bQ7TPM1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Prrc2bQ7TPM1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Prrc2bQ7TPM1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Prrc2bQ7TPM1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Prrc2bQ7TPM1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Prrc2bQ7TPM1 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Prrc2bQ7TPM1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Prrc2bQ7TPM1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Prrc2bQ7TPM1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Prrc2bQ7TPM1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Prrc2bQ7TPM1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Prrc2bQ7TPM1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Prrc2bQ7TPM1 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Prrc2bQ7TPM1 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Prrc2bQ7TPM1 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Prrc2bQ7TPM1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Prrc2bQ7TPM1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Prrc2bQ7TPM1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Prrc2bQ7TPM1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Prrc2bQ7TPM1 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Prrc2bQ7TPM1 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Prrc2bQ7TPM1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Prrc2bQ7TPM1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Prrc2bQ7TPM1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Prrc2bQ7TPM1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Prrc2bQ7TPM1 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Prrc2bQ7TPM1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Prrc2bQ7TPM1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Prrc2bQ7TPM1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Prrc2bQ7TPM1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Prrc2bQ7TPM1 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Prrc2bQ7TPM1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Prrc2bQ7TPM1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Prrc2bQ7TPM1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Prrc2bQ7TPM1 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Prrc2bQ7TPM1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Prrc2bQ7TPM1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Prrc2bQ7TPM1 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Prrc2bQ7TPM1 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Prrc2bQ7TPM1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Prrc2bQ7TPM1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Prrc2bQ7TPM1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Prrc2bQ7TPM1 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Prrc2bQ7TPM1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Prrc2bQ7TPM1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Prrc2bQ7TPM1 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Prrc2bQ7TPM1 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Prrc2bQ7TPM1 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Prrc2bQ7TPM1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Prrc2bQ7TPM1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Prrc2bQ7TPM1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Prrc2bQ7TPM1 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Prrc2bQ7TPM1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Prrc2bQ7TPM1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Prrc2bQ7TPM1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Prrc2bQ7TPM1 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Prrc2bQ7TPM1 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Prrc2bQ7TPM1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Prrc2bQ7TPM1 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Prrc2bQ7TPM1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Prrc2bQ7TPM1 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Prrc2bQ7TPM1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Prrc2bQ7TPM1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Prrc2bQ7TPM1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Prrc2bQ7TPM1 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Prrc2bQ7TPM1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Prrc2bQ7TPM1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Prrc2bQ7TPM1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Prrc2bQ7TPM1 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Prrc2bQ7TPM1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Prrc2bQ7TPM1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Prrc2bQ7TPM1 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Prrc2bQ7TPM1 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Prrc2bQ7TPM1 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Prrc2bQ7TPM1 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Prrc2bQ7TPM1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Prrc2bQ7TPM1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Prrc2bQ7TPM1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Prrc2bQ7TPM1 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Prrc2bQ7TPM1 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Prrc2bQ7TPM1 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Prrc2bQ7TPM1 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Prrc2bQ7TPM1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Prrc2bQ7TPM1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Prrc2bQ7TPM1 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Prrc2bQ7TPM1 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Prrc2bQ7TPM1 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Prrc2bQ7TPM1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Prrc2bQ7TPM1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms