Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNL3

Stk40, Serine/threonine-protein kinase 40, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stk40Q7TNL3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Stk40Q7TNL3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Stk40Q7TNL3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Stk40Q7TNL3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Stk40Q7TNL3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Stk40Q7TNL3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Stk40Q7TNL3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Stk40Q7TNL3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Stk40Q7TNL3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Stk40Q7TNL3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Stk40Q7TNL3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Stk40Q7TNL3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Stk40Q7TNL3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Stk40Q7TNL3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Stk40Q7TNL3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Stk40Q7TNL3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Stk40Q7TNL3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Stk40Q7TNL3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Stk40Q7TNL3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Stk40Q7TNL3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Stk40Q7TNL3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Stk40Q7TNL3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Stk40Q7TNL3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Stk40Q7TNL3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Stk40Q7TNL3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Stk40Q7TNL3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Stk40Q7TNL3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Stk40Q7TNL3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Stk40Q7TNL3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Stk40Q7TNL3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Stk40Q7TNL3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Stk40Q7TNL3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Stk40Q7TNL3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Stk40Q7TNL3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Stk40Q7TNL3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Stk40Q7TNL3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Stk40Q7TNL3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Stk40Q7TNL3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Stk40Q7TNL3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Stk40Q7TNL3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Stk40Q7TNL3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Stk40Q7TNL3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Stk40Q7TNL3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Stk40Q7TNL3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Stk40Q7TNL3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Stk40Q7TNL3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Stk40Q7TNL3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Stk40Q7TNL3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Stk40Q7TNL3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Stk40Q7TNL3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Stk40Q7TNL3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Stk40Q7TNL3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Stk40Q7TNL3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Stk40Q7TNL3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Stk40Q7TNL3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Stk40Q7TNL3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Stk40Q7TNL3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Stk40Q7TNL3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Stk40Q7TNL3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Stk40Q7TNL3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Stk40Q7TNL3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Stk40Q7TNL3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Stk40Q7TNL3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Stk40Q7TNL3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Stk40Q7TNL3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Stk40Q7TNL3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Stk40Q7TNL3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Stk40Q7TNL3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Stk40Q7TNL3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Stk40Q7TNL3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Stk40Q7TNL3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Stk40Q7TNL3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Stk40Q7TNL3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Stk40Q7TNL3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Stk40Q7TNL3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Stk40Q7TNL3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Stk40Q7TNL3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Stk40Q7TNL3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Stk40Q7TNL3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Stk40Q7TNL3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Stk40Q7TNL3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Stk40Q7TNL3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Stk40Q7TNL3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Stk40Q7TNL3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Stk40Q7TNL3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Stk40Q7TNL3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Stk40Q7TNL3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Stk40Q7TNL3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Stk40Q7TNL3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Stk40Q7TNL3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Stk40Q7TNL3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Stk40Q7TNL3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Stk40Q7TNL3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Stk40Q7TNL3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Stk40Q7TNL3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Stk40Q7TNL3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Stk40Q7TNL3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Stk40Q7TNL3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Stk40Q7TNL3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Stk40Q7TNL3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.5 ms