Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNH6

Nphp3, Nephrocystin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp3Q7TNH6 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nphp3Q7TNH6 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nphp3Q7TNH6 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nphp3Q7TNH6 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nphp3Q7TNH6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nphp3Q7TNH6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nphp3Q7TNH6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nphp3Q7TNH6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nphp3Q7TNH6 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nphp3Q7TNH6 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nphp3Q7TNH6 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nphp3Q7TNH6 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nphp3Q7TNH6 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nphp3Q7TNH6 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nphp3Q7TNH6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nphp3Q7TNH6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nphp3Q7TNH6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nphp3Q7TNH6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nphp3Q7TNH6 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nphp3Q7TNH6 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Nphp3Q7TNH6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nphp3Q7TNH6 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nphp3Q7TNH6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nphp3Q7TNH6 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nphp3Q7TNH6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nphp3Q7TNH6 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nphp3Q7TNH6 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nphp3Q7TNH6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nphp3Q7TNH6 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Nphp3Q7TNH6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nphp3Q7TNH6 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nphp3Q7TNH6 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nphp3Q7TNH6 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nphp3Q7TNH6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nphp3Q7TNH6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nphp3Q7TNH6 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nphp3Q7TNH6 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nphp3Q7TNH6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nphp3Q7TNH6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nphp3Q7TNH6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nphp3Q7TNH6 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nphp3Q7TNH6 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nphp3Q7TNH6 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nphp3Q7TNH6 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Nphp3Q7TNH6 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nphp3Q7TNH6 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Nphp3Q7TNH6 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nphp3Q7TNH6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nphp3Q7TNH6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nphp3Q7TNH6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nphp3Q7TNH6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nphp3Q7TNH6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nphp3Q7TNH6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nphp3Q7TNH6 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Nphp3Q7TNH6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nphp3Q7TNH6 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nphp3Q7TNH6 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nphp3Q7TNH6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nphp3Q7TNH6 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nphp3Q7TNH6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nphp3Q7TNH6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nphp3Q7TNH6 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nphp3Q7TNH6 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nphp3Q7TNH6 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nphp3Q7TNH6 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nphp3Q7TNH6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nphp3Q7TNH6 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nphp3Q7TNH6 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nphp3Q7TNH6 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nphp3Q7TNH6 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Nphp3Q7TNH6 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Nphp3Q7TNH6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nphp3Q7TNH6 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nphp3Q7TNH6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nphp3Q7TNH6 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nphp3Q7TNH6 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nphp3Q7TNH6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nphp3Q7TNH6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nphp3Q7TNH6 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nphp3Q7TNH6 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nphp3Q7TNH6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nphp3Q7TNH6 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nphp3Q7TNH6 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nphp3Q7TNH6 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nphp3Q7TNH6 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nphp3Q7TNH6 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Nphp3Q7TNH6 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nphp3Q7TNH6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nphp3Q7TNH6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nphp3Q7TNH6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nphp3Q7TNH6 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nphp3Q7TNH6 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nphp3Q7TNH6 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nphp3Q7TNH6 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nphp3Q7TNH6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nphp3Q7TNH6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nphp3Q7TNH6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nphp3Q7TNH6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nphp3Q7TNH6 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nphp3Q7TNH6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms