Protein–RNA interactions for Protein: Q7TND5

Rpf1, Ribosome production factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpf1Q7TND5 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rpf1Q7TND5 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rpf1Q7TND5 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rpf1Q7TND5 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rpf1Q7TND5 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Rpf1Q7TND5 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rpf1Q7TND5 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rpf1Q7TND5 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rpf1Q7TND5 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rpf1Q7TND5 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rpf1Q7TND5 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Rpf1Q7TND5 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rpf1Q7TND5 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rpf1Q7TND5 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rpf1Q7TND5 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rpf1Q7TND5 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rpf1Q7TND5 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rpf1Q7TND5 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rpf1Q7TND5 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rpf1Q7TND5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rpf1Q7TND5 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rpf1Q7TND5 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rpf1Q7TND5 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rpf1Q7TND5 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rpf1Q7TND5 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rpf1Q7TND5 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rpf1Q7TND5 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rpf1Q7TND5 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rpf1Q7TND5 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Rpf1Q7TND5 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rpf1Q7TND5 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rpf1Q7TND5 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rpf1Q7TND5 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rpf1Q7TND5 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rpf1Q7TND5 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rpf1Q7TND5 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rpf1Q7TND5 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rpf1Q7TND5 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Rpf1Q7TND5 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Rpf1Q7TND5 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rpf1Q7TND5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rpf1Q7TND5 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rpf1Q7TND5 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Rpf1Q7TND5 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rpf1Q7TND5 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rpf1Q7TND5 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Rpf1Q7TND5 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rpf1Q7TND5 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rpf1Q7TND5 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rpf1Q7TND5 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Rpf1Q7TND5 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rpf1Q7TND5 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rpf1Q7TND5 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Rpf1Q7TND5 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rpf1Q7TND5 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rpf1Q7TND5 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rpf1Q7TND5 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rpf1Q7TND5 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rpf1Q7TND5 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rpf1Q7TND5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rpf1Q7TND5 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rpf1Q7TND5 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rpf1Q7TND5 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rpf1Q7TND5 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rpf1Q7TND5 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rpf1Q7TND5 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rpf1Q7TND5 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rpf1Q7TND5 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rpf1Q7TND5 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rpf1Q7TND5 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rpf1Q7TND5 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rpf1Q7TND5 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Rpf1Q7TND5 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rpf1Q7TND5 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rpf1Q7TND5 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Rpf1Q7TND5 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rpf1Q7TND5 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rpf1Q7TND5 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rpf1Q7TND5 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rpf1Q7TND5 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rpf1Q7TND5 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rpf1Q7TND5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rpf1Q7TND5 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rpf1Q7TND5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rpf1Q7TND5 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rpf1Q7TND5 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rpf1Q7TND5 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rpf1Q7TND5 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Rpf1Q7TND5 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rpf1Q7TND5 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rpf1Q7TND5 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rpf1Q7TND5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rpf1Q7TND5 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rpf1Q7TND5 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rpf1Q7TND5 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rpf1Q7TND5 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Rpf1Q7TND5 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rpf1Q7TND5 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rpf1Q7TND5 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rpf1Q7TND5 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms