Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNB8

Sbno2, Protein strawberry notch homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno2Q7TNB8 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sbno2Q7TNB8 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sbno2Q7TNB8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sbno2Q7TNB8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sbno2Q7TNB8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sbno2Q7TNB8 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sbno2Q7TNB8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sbno2Q7TNB8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sbno2Q7TNB8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sbno2Q7TNB8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sbno2Q7TNB8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sbno2Q7TNB8 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sbno2Q7TNB8 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sbno2Q7TNB8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sbno2Q7TNB8 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sbno2Q7TNB8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sbno2Q7TNB8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sbno2Q7TNB8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sbno2Q7TNB8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sbno2Q7TNB8 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sbno2Q7TNB8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sbno2Q7TNB8 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sbno2Q7TNB8 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sbno2Q7TNB8 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Sbno2Q7TNB8 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sbno2Q7TNB8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sbno2Q7TNB8 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sbno2Q7TNB8 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Sbno2Q7TNB8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sbno2Q7TNB8 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Sbno2Q7TNB8 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sbno2Q7TNB8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sbno2Q7TNB8 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sbno2Q7TNB8 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sbno2Q7TNB8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sbno2Q7TNB8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sbno2Q7TNB8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sbno2Q7TNB8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sbno2Q7TNB8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Sbno2Q7TNB8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sbno2Q7TNB8 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sbno2Q7TNB8 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sbno2Q7TNB8 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sbno2Q7TNB8 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sbno2Q7TNB8 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sbno2Q7TNB8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sbno2Q7TNB8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sbno2Q7TNB8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sbno2Q7TNB8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sbno2Q7TNB8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sbno2Q7TNB8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sbno2Q7TNB8 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sbno2Q7TNB8 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Sbno2Q7TNB8 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sbno2Q7TNB8 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sbno2Q7TNB8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sbno2Q7TNB8 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sbno2Q7TNB8 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sbno2Q7TNB8 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sbno2Q7TNB8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sbno2Q7TNB8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sbno2Q7TNB8 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sbno2Q7TNB8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sbno2Q7TNB8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sbno2Q7TNB8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sbno2Q7TNB8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sbno2Q7TNB8 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sbno2Q7TNB8 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sbno2Q7TNB8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sbno2Q7TNB8 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sbno2Q7TNB8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sbno2Q7TNB8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sbno2Q7TNB8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sbno2Q7TNB8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sbno2Q7TNB8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sbno2Q7TNB8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sbno2Q7TNB8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Sbno2Q7TNB8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sbno2Q7TNB8 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Sbno2Q7TNB8 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sbno2Q7TNB8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sbno2Q7TNB8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sbno2Q7TNB8 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sbno2Q7TNB8 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sbno2Q7TNB8 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Sbno2Q7TNB8 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sbno2Q7TNB8 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sbno2Q7TNB8 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sbno2Q7TNB8 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sbno2Q7TNB8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sbno2Q7TNB8 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sbno2Q7TNB8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sbno2Q7TNB8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sbno2Q7TNB8 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sbno2Q7TNB8 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sbno2Q7TNB8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sbno2Q7TNB8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sbno2Q7TNB8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sbno2Q7TNB8 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sbno2Q7TNB8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms