Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN88

Pkd1l2, Polycystic kidney disease protein 1-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd1l2Q7TN88 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pkd1l2Q7TN88 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pkd1l2Q7TN88 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pkd1l2Q7TN88 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pkd1l2Q7TN88 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pkd1l2Q7TN88 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Pkd1l2Q7TN88 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pkd1l2Q7TN88 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pkd1l2Q7TN88 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pkd1l2Q7TN88 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Pkd1l2Q7TN88 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pkd1l2Q7TN88 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pkd1l2Q7TN88 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pkd1l2Q7TN88 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pkd1l2Q7TN88 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Pkd1l2Q7TN88 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pkd1l2Q7TN88 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Pkd1l2Q7TN88 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pkd1l2Q7TN88 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pkd1l2Q7TN88 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Pkd1l2Q7TN88 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pkd1l2Q7TN88 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pkd1l2Q7TN88 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pkd1l2Q7TN88 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pkd1l2Q7TN88 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pkd1l2Q7TN88 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pkd1l2Q7TN88 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pkd1l2Q7TN88 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pkd1l2Q7TN88 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pkd1l2Q7TN88 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pkd1l2Q7TN88 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pkd1l2Q7TN88 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pkd1l2Q7TN88 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkd1l2Q7TN88 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkd1l2Q7TN88 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkd1l2Q7TN88 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkd1l2Q7TN88 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkd1l2Q7TN88 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkd1l2Q7TN88 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkd1l2Q7TN88 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkd1l2Q7TN88 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkd1l2Q7TN88 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkd1l2Q7TN88 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkd1l2Q7TN88 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkd1l2Q7TN88 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkd1l2Q7TN88 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkd1l2Q7TN88 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkd1l2Q7TN88 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkd1l2Q7TN88 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkd1l2Q7TN88 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkd1l2Q7TN88 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkd1l2Q7TN88 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkd1l2Q7TN88 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkd1l2Q7TN88 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkd1l2Q7TN88 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkd1l2Q7TN88 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkd1l2Q7TN88 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkd1l2Q7TN88 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkd1l2Q7TN88 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkd1l2Q7TN88 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkd1l2Q7TN88 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkd1l2Q7TN88 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkd1l2Q7TN88 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkd1l2Q7TN88 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkd1l2Q7TN88 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkd1l2Q7TN88 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkd1l2Q7TN88 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkd1l2Q7TN88 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkd1l2Q7TN88 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkd1l2Q7TN88 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkd1l2Q7TN88 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkd1l2Q7TN88 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkd1l2Q7TN88 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkd1l2Q7TN88 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkd1l2Q7TN88 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkd1l2Q7TN88 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pkd1l2Q7TN88 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pkd1l2Q7TN88 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pkd1l2Q7TN88 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pkd1l2Q7TN88 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pkd1l2Q7TN88 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pkd1l2Q7TN88 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pkd1l2Q7TN88 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Pkd1l2Q7TN88 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pkd1l2Q7TN88 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pkd1l2Q7TN88 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pkd1l2Q7TN88 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkd1l2Q7TN88 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkd1l2Q7TN88 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkd1l2Q7TN88 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkd1l2Q7TN88 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkd1l2Q7TN88 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkd1l2Q7TN88 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkd1l2Q7TN88 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkd1l2Q7TN88 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkd1l2Q7TN88 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkd1l2Q7TN88 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkd1l2Q7TN88 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkd1l2Q7TN88 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkd1l2Q7TN88 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms