Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN58

Tmc8, Transmembrane channel-like protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmc8Q7TN58 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmc8Q7TN58 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmc8Q7TN58 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmc8Q7TN58 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmc8Q7TN58 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmc8Q7TN58 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmc8Q7TN58 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmc8Q7TN58 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmc8Q7TN58 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmc8Q7TN58 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmc8Q7TN58 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmc8Q7TN58 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tmc8Q7TN58 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tmc8Q7TN58 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tmc8Q7TN58 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmc8Q7TN58 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmc8Q7TN58 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmc8Q7TN58 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmc8Q7TN58 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmc8Q7TN58 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmc8Q7TN58 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmc8Q7TN58 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmc8Q7TN58 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmc8Q7TN58 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmc8Q7TN58 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmc8Q7TN58 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmc8Q7TN58 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmc8Q7TN58 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmc8Q7TN58 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmc8Q7TN58 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmc8Q7TN58 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmc8Q7TN58 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmc8Q7TN58 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmc8Q7TN58 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmc8Q7TN58 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmc8Q7TN58 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmc8Q7TN58 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmc8Q7TN58 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmc8Q7TN58 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmc8Q7TN58 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmc8Q7TN58 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmc8Q7TN58 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmc8Q7TN58 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmc8Q7TN58 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmc8Q7TN58 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmc8Q7TN58 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmc8Q7TN58 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmc8Q7TN58 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmc8Q7TN58 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmc8Q7TN58 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmc8Q7TN58 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmc8Q7TN58 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmc8Q7TN58 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmc8Q7TN58 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmc8Q7TN58 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmc8Q7TN58 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmc8Q7TN58 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmc8Q7TN58 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmc8Q7TN58 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmc8Q7TN58 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmc8Q7TN58 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmc8Q7TN58 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmc8Q7TN58 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmc8Q7TN58 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Tmc8Q7TN58 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Tmc8Q7TN58 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmc8Q7TN58 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmc8Q7TN58 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmc8Q7TN58 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmc8Q7TN58 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmc8Q7TN58 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmc8Q7TN58 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmc8Q7TN58 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmc8Q7TN58 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmc8Q7TN58 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmc8Q7TN58 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmc8Q7TN58 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmc8Q7TN58 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmc8Q7TN58 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmc8Q7TN58 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmc8Q7TN58 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmc8Q7TN58 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmc8Q7TN58 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmc8Q7TN58 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmc8Q7TN58 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmc8Q7TN58 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmc8Q7TN58 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmc8Q7TN58 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmc8Q7TN58 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmc8Q7TN58 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmc8Q7TN58 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmc8Q7TN58 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmc8Q7TN58 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmc8Q7TN58 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmc8Q7TN58 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmc8Q7TN58 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmc8Q7TN58 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmc8Q7TN58 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmc8Q7TN58 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmc8Q7TN58 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms