Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMM9

Tubb2a, Tubulin beta-2A chain, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb2aQ7TMM9 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tubb2aQ7TMM9 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tubb2aQ7TMM9 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tubb2aQ7TMM9 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tubb2aQ7TMM9 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tubb2aQ7TMM9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tubb2aQ7TMM9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Tubb2aQ7TMM9 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tubb2aQ7TMM9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tubb2aQ7TMM9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tubb2aQ7TMM9 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tubb2aQ7TMM9 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tubb2aQ7TMM9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tubb2aQ7TMM9 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tubb2aQ7TMM9 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tubb2aQ7TMM9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Tubb2aQ7TMM9 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tubb2aQ7TMM9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tubb2aQ7TMM9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tubb2aQ7TMM9 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tubb2aQ7TMM9 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tubb2aQ7TMM9 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tubb2aQ7TMM9 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tubb2aQ7TMM9 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tubb2aQ7TMM9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tubb2aQ7TMM9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tubb2aQ7TMM9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tubb2aQ7TMM9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tubb2aQ7TMM9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tubb2aQ7TMM9 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tubb2aQ7TMM9 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tubb2aQ7TMM9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tubb2aQ7TMM9 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tubb2aQ7TMM9 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tubb2aQ7TMM9 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tubb2aQ7TMM9 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tubb2aQ7TMM9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tubb2aQ7TMM9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tubb2aQ7TMM9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tubb2aQ7TMM9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tubb2aQ7TMM9 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tubb2aQ7TMM9 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tubb2aQ7TMM9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tubb2aQ7TMM9 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tubb2aQ7TMM9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tubb2aQ7TMM9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Tubb2aQ7TMM9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tubb2aQ7TMM9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tubb2aQ7TMM9 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Tubb2aQ7TMM9 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tubb2aQ7TMM9 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tubb2aQ7TMM9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tubb2aQ7TMM9 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tubb2aQ7TMM9 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tubb2aQ7TMM9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tubb2aQ7TMM9 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tubb2aQ7TMM9 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tubb2aQ7TMM9 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tubb2aQ7TMM9 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tubb2aQ7TMM9 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Tubb2aQ7TMM9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tubb2aQ7TMM9 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tubb2aQ7TMM9 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tubb2aQ7TMM9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tubb2aQ7TMM9 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tubb2aQ7TMM9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Tubb2aQ7TMM9 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tubb2aQ7TMM9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Tubb2aQ7TMM9 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tubb2aQ7TMM9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tubb2aQ7TMM9 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tubb2aQ7TMM9 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tubb2aQ7TMM9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Tubb2aQ7TMM9 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tubb2aQ7TMM9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tubb2aQ7TMM9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tubb2aQ7TMM9 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Tubb2aQ7TMM9 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tubb2aQ7TMM9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tubb2aQ7TMM9 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tubb2aQ7TMM9 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tubb2aQ7TMM9 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tubb2aQ7TMM9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Tubb2aQ7TMM9 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tubb2aQ7TMM9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tubb2aQ7TMM9 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tubb2aQ7TMM9 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tubb2aQ7TMM9 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Tubb2aQ7TMM9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tubb2aQ7TMM9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tubb2aQ7TMM9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tubb2aQ7TMM9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tubb2aQ7TMM9 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tubb2aQ7TMM9 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tubb2aQ7TMM9 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tubb2aQ7TMM9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tubb2aQ7TMM9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tubb2aQ7TMM9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tubb2aQ7TMM9 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tubb2aQ7TMM9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms