Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMI3

Uhrf2, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF2, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf2Q7TMI3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Uhrf2Q7TMI3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Uhrf2Q7TMI3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Uhrf2Q7TMI3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Uhrf2Q7TMI3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Uhrf2Q7TMI3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Uhrf2Q7TMI3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Uhrf2Q7TMI3 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Uhrf2Q7TMI3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Uhrf2Q7TMI3 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Uhrf2Q7TMI3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Uhrf2Q7TMI3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Uhrf2Q7TMI3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Uhrf2Q7TMI3 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Uhrf2Q7TMI3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Uhrf2Q7TMI3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Uhrf2Q7TMI3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Uhrf2Q7TMI3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Uhrf2Q7TMI3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Uhrf2Q7TMI3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Uhrf2Q7TMI3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Uhrf2Q7TMI3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Uhrf2Q7TMI3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Uhrf2Q7TMI3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Uhrf2Q7TMI3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Uhrf2Q7TMI3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Uhrf2Q7TMI3 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Uhrf2Q7TMI3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Uhrf2Q7TMI3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Uhrf2Q7TMI3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Uhrf2Q7TMI3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Uhrf2Q7TMI3 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Uhrf2Q7TMI3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Uhrf2Q7TMI3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Uhrf2Q7TMI3 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Uhrf2Q7TMI3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Uhrf2Q7TMI3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Uhrf2Q7TMI3 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Uhrf2Q7TMI3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Uhrf2Q7TMI3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Uhrf2Q7TMI3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Uhrf2Q7TMI3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Uhrf2Q7TMI3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Uhrf2Q7TMI3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Uhrf2Q7TMI3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Uhrf2Q7TMI3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Uhrf2Q7TMI3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Uhrf2Q7TMI3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Uhrf2Q7TMI3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Uhrf2Q7TMI3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Uhrf2Q7TMI3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Uhrf2Q7TMI3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Uhrf2Q7TMI3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Uhrf2Q7TMI3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Uhrf2Q7TMI3 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Uhrf2Q7TMI3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Uhrf2Q7TMI3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Uhrf2Q7TMI3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Uhrf2Q7TMI3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Uhrf2Q7TMI3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Uhrf2Q7TMI3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Uhrf2Q7TMI3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Uhrf2Q7TMI3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Uhrf2Q7TMI3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Uhrf2Q7TMI3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Uhrf2Q7TMI3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Uhrf2Q7TMI3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Uhrf2Q7TMI3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Uhrf2Q7TMI3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Uhrf2Q7TMI3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Uhrf2Q7TMI3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Uhrf2Q7TMI3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Uhrf2Q7TMI3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Uhrf2Q7TMI3 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Uhrf2Q7TMI3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Uhrf2Q7TMI3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Uhrf2Q7TMI3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Uhrf2Q7TMI3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Uhrf2Q7TMI3 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Uhrf2Q7TMI3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Uhrf2Q7TMI3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Uhrf2Q7TMI3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Uhrf2Q7TMI3 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Uhrf2Q7TMI3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Uhrf2Q7TMI3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Uhrf2Q7TMI3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Uhrf2Q7TMI3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Uhrf2Q7TMI3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Uhrf2Q7TMI3 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Uhrf2Q7TMI3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Uhrf2Q7TMI3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Uhrf2Q7TMI3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Uhrf2Q7TMI3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Uhrf2Q7TMI3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Uhrf2Q7TMI3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Uhrf2Q7TMI3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Uhrf2Q7TMI3 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Uhrf2Q7TMI3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Uhrf2Q7TMI3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Uhrf2Q7TMI3 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms