Protein–RNA interactions for Protein: Q78RX3

Smim12, Small integral membrane protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim12Q78RX3 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smim12Q78RX3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smim12Q78RX3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smim12Q78RX3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smim12Q78RX3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smim12Q78RX3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smim12Q78RX3 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smim12Q78RX3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smim12Q78RX3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smim12Q78RX3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smim12Q78RX3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smim12Q78RX3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smim12Q78RX3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smim12Q78RX3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smim12Q78RX3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smim12Q78RX3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smim12Q78RX3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smim12Q78RX3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smim12Q78RX3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smim12Q78RX3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smim12Q78RX3 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smim12Q78RX3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smim12Q78RX3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smim12Q78RX3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smim12Q78RX3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smim12Q78RX3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Smim12Q78RX3 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Smim12Q78RX3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smim12Q78RX3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smim12Q78RX3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smim12Q78RX3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smim12Q78RX3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smim12Q78RX3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smim12Q78RX3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Smim12Q78RX3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smim12Q78RX3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smim12Q78RX3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smim12Q78RX3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Smim12Q78RX3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smim12Q78RX3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smim12Q78RX3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smim12Q78RX3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smim12Q78RX3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smim12Q78RX3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smim12Q78RX3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smim12Q78RX3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smim12Q78RX3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smim12Q78RX3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smim12Q78RX3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smim12Q78RX3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smim12Q78RX3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smim12Q78RX3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smim12Q78RX3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smim12Q78RX3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smim12Q78RX3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smim12Q78RX3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smim12Q78RX3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smim12Q78RX3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smim12Q78RX3 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smim12Q78RX3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smim12Q78RX3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smim12Q78RX3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smim12Q78RX3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smim12Q78RX3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smim12Q78RX3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smim12Q78RX3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smim12Q78RX3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smim12Q78RX3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smim12Q78RX3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smim12Q78RX3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smim12Q78RX3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smim12Q78RX3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smim12Q78RX3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smim12Q78RX3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smim12Q78RX3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smim12Q78RX3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smim12Q78RX3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Smim12Q78RX3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smim12Q78RX3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smim12Q78RX3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Smim12Q78RX3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smim12Q78RX3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smim12Q78RX3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smim12Q78RX3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smim12Q78RX3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Smim12Q78RX3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Smim12Q78RX3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smim12Q78RX3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smim12Q78RX3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smim12Q78RX3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smim12Q78RX3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smim12Q78RX3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smim12Q78RX3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smim12Q78RX3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smim12Q78RX3 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smim12Q78RX3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smim12Q78RX3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smim12Q78RX3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smim12Q78RX3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smim12Q78RX3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms