Protein–RNA interactions for Protein: Q78IK2

Usmg5, Up-regulated during skeletal muscle growth protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usmg5Q78IK2 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usmg5Q78IK2 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Usmg5Q78IK2 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usmg5Q78IK2 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usmg5Q78IK2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usmg5Q78IK2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usmg5Q78IK2 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usmg5Q78IK2 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usmg5Q78IK2 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usmg5Q78IK2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usmg5Q78IK2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usmg5Q78IK2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usmg5Q78IK2 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usmg5Q78IK2 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usmg5Q78IK2 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usmg5Q78IK2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usmg5Q78IK2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usmg5Q78IK2 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usmg5Q78IK2 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usmg5Q78IK2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usmg5Q78IK2 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usmg5Q78IK2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Usmg5Q78IK2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usmg5Q78IK2 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usmg5Q78IK2 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usmg5Q78IK2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usmg5Q78IK2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usmg5Q78IK2 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usmg5Q78IK2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usmg5Q78IK2 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Usmg5Q78IK2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usmg5Q78IK2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usmg5Q78IK2 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usmg5Q78IK2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usmg5Q78IK2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usmg5Q78IK2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usmg5Q78IK2 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usmg5Q78IK2 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usmg5Q78IK2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usmg5Q78IK2 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usmg5Q78IK2 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usmg5Q78IK2 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usmg5Q78IK2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usmg5Q78IK2 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usmg5Q78IK2 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usmg5Q78IK2 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usmg5Q78IK2 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Usmg5Q78IK2 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usmg5Q78IK2 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usmg5Q78IK2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usmg5Q78IK2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usmg5Q78IK2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usmg5Q78IK2 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usmg5Q78IK2 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usmg5Q78IK2 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usmg5Q78IK2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usmg5Q78IK2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usmg5Q78IK2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usmg5Q78IK2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usmg5Q78IK2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usmg5Q78IK2 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usmg5Q78IK2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usmg5Q78IK2 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usmg5Q78IK2 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usmg5Q78IK2 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usmg5Q78IK2 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Usmg5Q78IK2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usmg5Q78IK2 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usmg5Q78IK2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usmg5Q78IK2 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usmg5Q78IK2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usmg5Q78IK2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usmg5Q78IK2 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usmg5Q78IK2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usmg5Q78IK2 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Usmg5Q78IK2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usmg5Q78IK2 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usmg5Q78IK2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usmg5Q78IK2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usmg5Q78IK2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usmg5Q78IK2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usmg5Q78IK2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usmg5Q78IK2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usmg5Q78IK2 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usmg5Q78IK2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usmg5Q78IK2 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usmg5Q78IK2 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usmg5Q78IK2 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usmg5Q78IK2 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usmg5Q78IK2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usmg5Q78IK2 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usmg5Q78IK2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usmg5Q78IK2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usmg5Q78IK2 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usmg5Q78IK2 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usmg5Q78IK2 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usmg5Q78IK2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usmg5Q78IK2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usmg5Q78IK2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usmg5Q78IK2 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms