Protein–RNA interactions for Protein: Q76I25

Higd1c, HIG1 domain family member 1C, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1cQ76I25 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Higd1cQ76I25 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Higd1cQ76I25 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Higd1cQ76I25 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Higd1cQ76I25 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Higd1cQ76I25 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Higd1cQ76I25 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Higd1cQ76I25 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Higd1cQ76I25 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Higd1cQ76I25 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Higd1cQ76I25 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Higd1cQ76I25 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Higd1cQ76I25 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Higd1cQ76I25 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Higd1cQ76I25 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Higd1cQ76I25 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Higd1cQ76I25 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Higd1cQ76I25 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Higd1cQ76I25 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Higd1cQ76I25 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Higd1cQ76I25 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Higd1cQ76I25 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Higd1cQ76I25 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Higd1cQ76I25 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Higd1cQ76I25 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Higd1cQ76I25 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Higd1cQ76I25 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Higd1cQ76I25 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Higd1cQ76I25 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Higd1cQ76I25 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Higd1cQ76I25 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Higd1cQ76I25 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Higd1cQ76I25 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Higd1cQ76I25 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Higd1cQ76I25 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Higd1cQ76I25 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Higd1cQ76I25 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Higd1cQ76I25 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Higd1cQ76I25 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Higd1cQ76I25 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Higd1cQ76I25 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Higd1cQ76I25 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Higd1cQ76I25 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Higd1cQ76I25 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Higd1cQ76I25 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Higd1cQ76I25 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Higd1cQ76I25 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Higd1cQ76I25 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Higd1cQ76I25 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Higd1cQ76I25 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Higd1cQ76I25 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Higd1cQ76I25 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Higd1cQ76I25 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Higd1cQ76I25 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Higd1cQ76I25 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Higd1cQ76I25 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Higd1cQ76I25 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Higd1cQ76I25 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Higd1cQ76I25 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Higd1cQ76I25 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Higd1cQ76I25 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Higd1cQ76I25 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Higd1cQ76I25 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Higd1cQ76I25 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Higd1cQ76I25 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Higd1cQ76I25 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Higd1cQ76I25 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Higd1cQ76I25 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Higd1cQ76I25 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Higd1cQ76I25 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Higd1cQ76I25 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Higd1cQ76I25 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Higd1cQ76I25 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Higd1cQ76I25 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Higd1cQ76I25 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Higd1cQ76I25 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Higd1cQ76I25 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Higd1cQ76I25 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Higd1cQ76I25 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Higd1cQ76I25 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Higd1cQ76I25 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Higd1cQ76I25 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Higd1cQ76I25 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Higd1cQ76I25 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Higd1cQ76I25 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Higd1cQ76I25 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Higd1cQ76I25 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Higd1cQ76I25 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Higd1cQ76I25 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Higd1cQ76I25 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Higd1cQ76I25 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Higd1cQ76I25 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Higd1cQ76I25 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Higd1cQ76I25 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Higd1cQ76I25 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Higd1cQ76I25 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Higd1cQ76I25 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Higd1cQ76I25 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Higd1cQ76I25 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Higd1cQ76I25 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms