Protein–RNA interactions for Protein: Q704Y3

Trpv1, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 1, mousemouse

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv1Q704Y3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trpv1Q704Y3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trpv1Q704Y3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trpv1Q704Y3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trpv1Q704Y3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trpv1Q704Y3 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trpv1Q704Y3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trpv1Q704Y3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trpv1Q704Y3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trpv1Q704Y3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trpv1Q704Y3 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trpv1Q704Y3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trpv1Q704Y3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trpv1Q704Y3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trpv1Q704Y3 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trpv1Q704Y3 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trpv1Q704Y3 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Trpv1Q704Y3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Trpv1Q704Y3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trpv1Q704Y3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trpv1Q704Y3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trpv1Q704Y3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trpv1Q704Y3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trpv1Q704Y3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trpv1Q704Y3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trpv1Q704Y3 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Trpv1Q704Y3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trpv1Q704Y3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trpv1Q704Y3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trpv1Q704Y3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trpv1Q704Y3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trpv1Q704Y3 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Trpv1Q704Y3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Trpv1Q704Y3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trpv1Q704Y3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trpv1Q704Y3 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trpv1Q704Y3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Trpv1Q704Y3 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Trpv1Q704Y3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trpv1Q704Y3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trpv1Q704Y3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trpv1Q704Y3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trpv1Q704Y3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trpv1Q704Y3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trpv1Q704Y3 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Trpv1Q704Y3 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trpv1Q704Y3 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trpv1Q704Y3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trpv1Q704Y3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trpv1Q704Y3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trpv1Q704Y3 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trpv1Q704Y3 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Trpv1Q704Y3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trpv1Q704Y3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trpv1Q704Y3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trpv1Q704Y3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trpv1Q704Y3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trpv1Q704Y3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trpv1Q704Y3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trpv1Q704Y3 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trpv1Q704Y3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trpv1Q704Y3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trpv1Q704Y3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trpv1Q704Y3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trpv1Q704Y3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trpv1Q704Y3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trpv1Q704Y3 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Trpv1Q704Y3 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Trpv1Q704Y3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trpv1Q704Y3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trpv1Q704Y3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trpv1Q704Y3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Trpv1Q704Y3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trpv1Q704Y3 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trpv1Q704Y3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trpv1Q704Y3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trpv1Q704Y3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trpv1Q704Y3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trpv1Q704Y3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trpv1Q704Y3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trpv1Q704Y3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Trpv1Q704Y3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trpv1Q704Y3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trpv1Q704Y3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trpv1Q704Y3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trpv1Q704Y3 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trpv1Q704Y3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trpv1Q704Y3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trpv1Q704Y3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trpv1Q704Y3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trpv1Q704Y3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trpv1Q704Y3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trpv1Q704Y3 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trpv1Q704Y3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trpv1Q704Y3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trpv1Q704Y3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trpv1Q704Y3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trpv1Q704Y3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trpv1Q704Y3 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trpv1Q704Y3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms