Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWY6

Ube2d2b, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D2B, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d2bQ6ZWY6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ube2d2bQ6ZWY6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ube2d2bQ6ZWY6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ube2d2bQ6ZWY6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ube2d2bQ6ZWY6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ube2d2bQ6ZWY6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ube2d2bQ6ZWY6 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ube2d2bQ6ZWY6 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ube2d2bQ6ZWY6 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ube2d2bQ6ZWY6 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ube2d2bQ6ZWY6 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ube2d2bQ6ZWY6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ube2d2bQ6ZWY6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ube2d2bQ6ZWY6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ube2d2bQ6ZWY6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ube2d2bQ6ZWY6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ube2d2bQ6ZWY6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ube2d2bQ6ZWY6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ube2d2bQ6ZWY6 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ube2d2bQ6ZWY6 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ube2d2bQ6ZWY6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ube2d2bQ6ZWY6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ube2d2bQ6ZWY6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ube2d2bQ6ZWY6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ube2d2bQ6ZWY6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ube2d2bQ6ZWY6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ube2d2bQ6ZWY6 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ube2d2bQ6ZWY6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ube2d2bQ6ZWY6 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ube2d2bQ6ZWY6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ube2d2bQ6ZWY6 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ube2d2bQ6ZWY6 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ube2d2bQ6ZWY6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube2d2bQ6ZWY6 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube2d2bQ6ZWY6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube2d2bQ6ZWY6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube2d2bQ6ZWY6 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube2d2bQ6ZWY6 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube2d2bQ6ZWY6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube2d2bQ6ZWY6 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube2d2bQ6ZWY6 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube2d2bQ6ZWY6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube2d2bQ6ZWY6 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube2d2bQ6ZWY6 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube2d2bQ6ZWY6 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube2d2bQ6ZWY6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube2d2bQ6ZWY6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ube2d2bQ6ZWY6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ube2d2bQ6ZWY6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ube2d2bQ6ZWY6 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ube2d2bQ6ZWY6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ube2d2bQ6ZWY6 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ube2d2bQ6ZWY6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ube2d2bQ6ZWY6 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ube2d2bQ6ZWY6 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ube2d2bQ6ZWY6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ube2d2bQ6ZWY6 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ube2d2bQ6ZWY6 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ube2d2bQ6ZWY6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ube2d2bQ6ZWY6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ube2d2bQ6ZWY6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ube2d2bQ6ZWY6 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ube2d2bQ6ZWY6 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ube2d2bQ6ZWY6 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube2d2bQ6ZWY6 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube2d2bQ6ZWY6 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube2d2bQ6ZWY6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube2d2bQ6ZWY6 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube2d2bQ6ZWY6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube2d2bQ6ZWY6 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube2d2bQ6ZWY6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube2d2bQ6ZWY6 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2d2bQ6ZWY6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2d2bQ6ZWY6 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2d2bQ6ZWY6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2d2bQ6ZWY6 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2d2bQ6ZWY6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2d2bQ6ZWY6 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2d2bQ6ZWY6 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2d2bQ6ZWY6 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2d2bQ6ZWY6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2d2bQ6ZWY6 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2d2bQ6ZWY6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2d2bQ6ZWY6 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2d2bQ6ZWY6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2d2bQ6ZWY6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2d2bQ6ZWY6 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2d2bQ6ZWY6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2d2bQ6ZWY6 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2d2bQ6ZWY6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2d2bQ6ZWY6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2d2bQ6ZWY6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2d2bQ6ZWY6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2d2bQ6ZWY6 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2d2bQ6ZWY6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2d2bQ6ZWY6 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms