Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWQ7

Spcs3, Signal peptidase complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spcs3Q6ZWQ7 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spcs3Q6ZWQ7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spcs3Q6ZWQ7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spcs3Q6ZWQ7 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spcs3Q6ZWQ7 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spcs3Q6ZWQ7 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spcs3Q6ZWQ7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spcs3Q6ZWQ7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spcs3Q6ZWQ7 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spcs3Q6ZWQ7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spcs3Q6ZWQ7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spcs3Q6ZWQ7 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spcs3Q6ZWQ7 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spcs3Q6ZWQ7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Spcs3Q6ZWQ7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spcs3Q6ZWQ7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spcs3Q6ZWQ7 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spcs3Q6ZWQ7 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spcs3Q6ZWQ7 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spcs3Q6ZWQ7 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spcs3Q6ZWQ7 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spcs3Q6ZWQ7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spcs3Q6ZWQ7 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spcs3Q6ZWQ7 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spcs3Q6ZWQ7 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spcs3Q6ZWQ7 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spcs3Q6ZWQ7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spcs3Q6ZWQ7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spcs3Q6ZWQ7 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spcs3Q6ZWQ7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spcs3Q6ZWQ7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spcs3Q6ZWQ7 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spcs3Q6ZWQ7 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Spcs3Q6ZWQ7 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spcs3Q6ZWQ7 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spcs3Q6ZWQ7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spcs3Q6ZWQ7 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spcs3Q6ZWQ7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spcs3Q6ZWQ7 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spcs3Q6ZWQ7 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spcs3Q6ZWQ7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spcs3Q6ZWQ7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spcs3Q6ZWQ7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spcs3Q6ZWQ7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spcs3Q6ZWQ7 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spcs3Q6ZWQ7 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spcs3Q6ZWQ7 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spcs3Q6ZWQ7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spcs3Q6ZWQ7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spcs3Q6ZWQ7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spcs3Q6ZWQ7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Spcs3Q6ZWQ7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spcs3Q6ZWQ7 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spcs3Q6ZWQ7 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spcs3Q6ZWQ7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spcs3Q6ZWQ7 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spcs3Q6ZWQ7 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spcs3Q6ZWQ7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spcs3Q6ZWQ7 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spcs3Q6ZWQ7 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spcs3Q6ZWQ7 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spcs3Q6ZWQ7 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spcs3Q6ZWQ7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spcs3Q6ZWQ7 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spcs3Q6ZWQ7 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spcs3Q6ZWQ7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spcs3Q6ZWQ7 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spcs3Q6ZWQ7 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spcs3Q6ZWQ7 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spcs3Q6ZWQ7 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spcs3Q6ZWQ7 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spcs3Q6ZWQ7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spcs3Q6ZWQ7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spcs3Q6ZWQ7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spcs3Q6ZWQ7 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spcs3Q6ZWQ7 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Spcs3Q6ZWQ7 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spcs3Q6ZWQ7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spcs3Q6ZWQ7 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Spcs3Q6ZWQ7 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spcs3Q6ZWQ7 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spcs3Q6ZWQ7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spcs3Q6ZWQ7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spcs3Q6ZWQ7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spcs3Q6ZWQ7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spcs3Q6ZWQ7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spcs3Q6ZWQ7 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spcs3Q6ZWQ7 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spcs3Q6ZWQ7 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spcs3Q6ZWQ7 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spcs3Q6ZWQ7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spcs3Q6ZWQ7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spcs3Q6ZWQ7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spcs3Q6ZWQ7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spcs3Q6ZWQ7 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spcs3Q6ZWQ7 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spcs3Q6ZWQ7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spcs3Q6ZWQ7 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spcs3Q6ZWQ7 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spcs3Q6ZWQ7 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms